More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1322 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  87.07 
 
 		 416 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  86.89 
 
 		 413 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 413 aa  826    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  78.21 
 
 		 413 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  71.19 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  71.03 
 
 		 452 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  69.9 
 
 		 416 aa  584  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  49.27 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.02 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  49.39 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.63 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  47.56 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.81 
 
 		 437 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 		 399 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  43.72 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  43.28 
 
 		 396 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  45.43 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.23 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 396 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.95 
 
 		 405 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.64 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  44.07 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2895  hypothetical protein  43.41 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  42.04 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  41.04 
 
 		 363 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  40.1 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0992  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.07 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137928  normal  0.200899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.6 
 
 		 358 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  40.35 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.19 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.91 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.72 
 
 		 348 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.81 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.81 
 
 		 370 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.6 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.42 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  35.34 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.16 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.42 
 
 		 356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.66 
 
 		 367 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.26 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.66 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  35.93 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.41 
 
 		 362 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.35 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.08 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.65 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.65 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.65 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.83 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.84 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.08 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.76 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.21 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.33 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.58 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.93 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.5 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.83 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.44 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.67 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  32.52 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.06 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.29 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.41 
 
 		 359 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.09 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.89 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 		 369 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.86 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.58 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.54 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.76 
 
 		 355 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.64 
 
 		 354 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.79 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.76 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.84 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.35 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.85 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.49 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.2 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.82 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  33 
 
 		 368 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.33 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.33 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.35 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.82 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  29.82 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.08 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>