More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0123 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  100 
 
 		 382 aa  762    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  69.39 
 
 		 390 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.08 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  62.69 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.02 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  58.06 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.06 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  62.71 
 
 		 368 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.43 
 
 		 378 aa  355  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.06 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.86 
 
 		 376 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  52.37 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.53 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  57.98 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.13 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.66 
 
 		 362 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.53 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.53 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.53 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.47 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 362 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.15 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.32 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.06 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.22 
 
 		 367 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.61 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.03 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.13 
 
 		 349 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.36 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 370 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.05 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  49.74 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.18 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.78 
 
 		 350 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.72 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.48 
 
 		 350 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  50.13 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.26 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.97 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  44.97 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.24 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.83 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.97 
 
 		 350 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  44.97 
 
 		 350 aa  292  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.97 
 
 		 350 aa  292  8e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.13 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.85 
 
 		 350 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.44 
 
 		 350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.88 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.48 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.21 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.77 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.26 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  45.38 
 
 		 352 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.24 
 
 		 358 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.66 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.73 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.36 
 
 		 381 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.11 
 
 		 355 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.18 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.86 
 
 		 355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.98 
 
 		 358 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.27 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.44 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.89 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.03 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.03 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.36 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.81 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.28 
 
 		 353 aa  225  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.5 
 
 		 410 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  36.15 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  34.83 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  35.63 
 
 		 412 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  36.52 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  35.9 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  39.58 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  34.51 
 
 		 405 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  34.81 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.45 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.4 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  38.01 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  33.41 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  37.43 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.33 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.19 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  38.36 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>