More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0623 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  95.03 
 
 		 362 aa  705    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  99.45 
 
 		 362 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  95.58 
 
 		 362 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  93.09 
 
 		 362 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  95.58 
 
 		 362 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  100 
 
 		 362 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  95.58 
 
 		 362 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  85.64 
 
 		 362 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  79.28 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  79.28 
 
 		 362 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  77.9 
 
 		 362 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  59 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  59.2 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  59.28 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.22 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  62.06 
 
 		 356 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.16 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  59.09 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.62 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.8 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.1 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.26 
 
 		 372 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.22 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.24 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.39 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.13 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.74 
 
 		 422 aa  348  7e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.14 
 
 		 350 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.57 
 
 		 370 aa  345  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.57 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.52 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.83 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.11 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.83 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 350 aa  342  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  50.55 
 
 		 353 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.25 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.45 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.54 
 
 		 375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.28 
 
 		 352 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.9 
 
 		 350 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  48.9 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.9 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.62 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  48.62 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  52.69 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.72 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.58 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.96 
 
 		 378 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.13 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  57.35 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  50.14 
 
 		 352 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 374 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  51 
 
 		 359 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.03 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.9 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.32 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.71 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  50.97 
 
 		 369 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.97 
 
 		 369 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.86 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  48 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.86 
 
 		 355 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.26 
 
 		 358 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.23 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.18 
 
 		 381 aa  279  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.26 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.08 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.66 
 
 		 362 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.93 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  43.7 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.35 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  35.81 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.16 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  40.16 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.48 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  38.28 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  35.75 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  38.32 
 
 		 395 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  34.17 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  34.43 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.39 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.07 
 
 		 377 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  39.02 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.77 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 		 358 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  32.44 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>