More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3272 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
411 aa  782    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  47.17 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.39 
 
 
450 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.63 
 
 
407 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  45.91 
 
 
395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  45.63 
 
 
424 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
421 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 
399 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.78 
 
 
404 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  37.16 
 
 
431 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.16 
 
 
437 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  41.58 
 
 
409 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
428 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  31.54 
 
 
444 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  34.79 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  32.94 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  30.71 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
440 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
395 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  36.46 
 
 
425 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  52.5 
 
 
409 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  34.99 
 
 
411 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  52.5 
 
 
409 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 
443 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 
427 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.7 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
436 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 
440 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.84 
 
 
460 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  37.08 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  33.97 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  39.67 
 
 
441 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.83 
 
 
887 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.67 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.36 
 
 
357 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  32.82 
 
 
466 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  31.82 
 
 
452 aa  126  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  28.87 
 
 
466 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.48 
 
 
876 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  29.75 
 
 
410 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.49 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.29 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.09 
 
 
470 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.81 
 
 
356 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.68 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  28.2 
 
 
459 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.63 
 
 
470 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.63 
 
 
470 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.63 
 
 
470 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.89 
 
 
362 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  24.58 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  33.05 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.67 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.32 
 
 
464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.14 
 
 
358 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
466 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.94 
 
 
467 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.6 
 
 
470 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.41 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.61 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.62 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.61 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.9 
 
 
362 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  32.41 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.16 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  33.16 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.64 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.65 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.41 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  30.1 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.44 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.94 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 
459 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.87 
 
 
464 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  34.69 
 
 
471 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  31.08 
 
 
402 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.1 
 
 
362 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.45 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  36.87 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.87 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.87 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  31.99 
 
 
416 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.14 
 
 
354 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  30.6 
 
 
459 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 
464 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.43 
 
 
469 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.83 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.76 
 
 
462 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.93 
 
 
422 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>