More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1137 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
407 aa  773    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  59.81 
 
 
437 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  50.63 
 
 
411 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  48.89 
 
 
395 aa  279  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  50.12 
 
 
424 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.03 
 
 
450 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  48.48 
 
 
399 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  37.81 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 
404 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  34.47 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  33.75 
 
 
444 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  38.29 
 
 
426 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.34 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 
395 aa  183  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  40.92 
 
 
409 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  35.86 
 
 
425 aa  179  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 
411 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  31.37 
 
 
437 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 
440 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.33 
 
 
379 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  52.61 
 
 
409 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  49.44 
 
 
431 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  56.74 
 
 
409 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.18 
 
 
428 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  43.02 
 
 
440 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  35.11 
 
 
436 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  32.12 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  42.46 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.18 
 
 
427 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.24 
 
 
466 aa  143  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  34.37 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.74 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.75 
 
 
887 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 
457 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.68 
 
 
460 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.19 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.21 
 
 
463 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.25 
 
 
470 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.62 
 
 
488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.44 
 
 
463 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.76 
 
 
463 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
461 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
357 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 
453 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  34.19 
 
 
441 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
327 aa  122  8e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  35.42 
 
 
601 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  26.02 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.39 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.39 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  35.85 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.78 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  35.85 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.54 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 
469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  37.2 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.5 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.39 
 
 
470 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  39.5 
 
 
362 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.37 
 
 
457 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  38.1 
 
 
471 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86747  mitochondrial enzyme D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  35.26 
 
 
587 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180539  normal  0.534514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.3 
 
 
469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  39.06 
 
 
469 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  38.3 
 
 
452 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.3 
 
 
469 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.1 
 
 
469 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.94 
 
 
470 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.46 
 
 
447 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  35.38 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  37.57 
 
 
469 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  35.38 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  34.74 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.07 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.1 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.17 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.08 
 
 
460 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 
461 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  36.15 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31583  mitochondrial D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  31.05 
 
 
612 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  36.61 
 
 
472 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  36.13 
 
 
474 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  38.22 
 
 
499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.5 
 
 
476 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  34.59 
 
 
560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  37.7 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.75 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0903  FAD linked oxidase domain protein  26.34 
 
 
359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0158726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  35.57 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.1 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>