More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1989 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  932    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.57 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.2 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  43.7 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  42.08 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  41.21 
 
 		 469 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.55 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.72 
 
 		 456 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.44 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.85 
 
 		 470 aa  320  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  40.43 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  40.73 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.73 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  41.67 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  39.61 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.19 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.57 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.41 
 
 		 458 aa  309  9e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.17 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.04 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 462 aa  290  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  37.62 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  38.63 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  37.56 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  40.74 
 
 		 473 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  36.49 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 		 471 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  40.38 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.87 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  39.21 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.21 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  37.25 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  37.34 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.44 
 
 		 477 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.61 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.55 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  35.09 
 
 		 557 aa  273  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  37.5 
 
 		 470 aa  273  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  38.73 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  37.5 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  39.48 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  38.5 
 
 		 475 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  36.68 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.38 
 
 		 468 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  36.3 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  34.62 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 		 481 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.23 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  35.75 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  35.75 
 
 		 472 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 		 476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.53 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.8 
 
 		 447 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 		 470 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  38.05 
 
 		 473 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 		 473 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.62 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.17 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  37.22 
 
 		 472 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.63 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  38 
 
 		 481 aa  263  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  36.83 
 
 		 470 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 468 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.13 
 
 		 523 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  38.6 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  34.89 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  37.01 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  36.62 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  38.16 
 
 		 477 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  33.05 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  36.26 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  36.6 
 
 		 470 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.1 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  38.17 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>