More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4490 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  930    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.35 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  51.73 
 
 
481 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  51.79 
 
 
468 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.56 
 
 
464 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  50.66 
 
 
470 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.08 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.9 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.75 
 
 
456 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  48.28 
 
 
476 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.27 
 
 
463 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.17 
 
 
473 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.28 
 
 
476 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.47 
 
 
476 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  48.81 
 
 
476 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.31 
 
 
469 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.76 
 
 
470 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.66 
 
 
476 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.36 
 
 
462 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.06 
 
 
476 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.66 
 
 
468 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  43.86 
 
 
471 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  45.06 
 
 
471 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  45.94 
 
 
469 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.96 
 
 
451 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  45.41 
 
 
469 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.26 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 
465 aa  319  7.999999999999999e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  41.36 
 
 
473 aa  309  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.88 
 
 
475 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  42.37 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  41.27 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
470 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.69 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.95 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  42.62 
 
 
489 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.15 
 
 
474 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  41.31 
 
 
480 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
489 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  39.42 
 
 
477 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.86 
 
 
475 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.29 
 
 
471 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 
481 aa  299  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.23 
 
 
478 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 
474 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  40.5 
 
 
463 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.37 
 
 
523 aa  297  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  40.38 
 
 
472 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 
489 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
477 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.85 
 
 
457 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  41.91 
 
 
470 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.72 
 
 
483 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.45 
 
 
473 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.22 
 
 
479 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.95 
 
 
472 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  39.25 
 
 
474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  39.45 
 
 
473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.45 
 
 
473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  39.03 
 
 
473 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
502 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
476 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.95 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  43.55 
 
 
478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  40.52 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
473 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  34.8 
 
 
557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.74 
 
 
476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.46 
 
 
470 aa  282  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  37.76 
 
 
470 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.55 
 
 
475 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.7 
 
 
472 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.25 
 
 
470 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.85 
 
 
480 aa  279  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 
480 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
483 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38.23 
 
 
470 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  38.46 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.67 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  38 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
472 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 
484 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  38.41 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  41.24 
 
 
464 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.33 
 
 
496 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 
489 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  39.5 
 
 
463 aa  272  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  36.61 
 
 
462 aa  272  9e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.43 
 
 
519 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.7 
 
 
481 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  35.35 
 
 
469 aa  271  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  41.98 
 
 
460 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  38.03 
 
 
473 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  38.7 
 
 
474 aa  269  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  37.9 
 
 
472 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  37.9 
 
 
472 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 
477 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>