More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1246 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  85.26 
 
 		 475 aa  834    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  75.11 
 
 		 480 aa  718    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  87.16 
 
 		 475 aa  852    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  78.63 
 
 		 474 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  78.24 
 
 		 475 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 489 aa  988    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  76.88 
 
 		 478 aa  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  61.29 
 
 		 470 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.08 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  60.86 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.71 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  58.89 
 
 		 478 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  59.06 
 
 		 476 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.66 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  56.99 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  56.99 
 
 		 476 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  59.66 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  53.12 
 
 		 469 aa  505  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.32 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.23 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  51.5 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  52.48 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  52.54 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.53 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  51.64 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.54 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  52.18 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.18 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.97 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.18 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  51.75 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  51.75 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  51.42 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.97 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.97 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  52.62 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  49.46 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.25 
 
 		 475 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  50.55 
 
 		 470 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  49.48 
 
 		 489 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  51.09 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.61 
 
 		 483 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  53.06 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  53.28 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3672  FAD linked oxidase domain protein  51.94 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  0.686407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.37 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  51.53 
 
 		 472 aa  422  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.61 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.72 
 
 		 489 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.97 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3782  FAD linked oxidase domain protein  52.27 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3474  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.05 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.641437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  51.08 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.45 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  48.31 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  48.83 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.01 
 
 		 472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  47.65 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  44.16 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.93 
 
 		 480 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  48.12 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  47.21 
 
 		 489 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.76 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  44.83 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4478  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.91 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408304  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.86 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  45.69 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.09 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5003  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.74 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.541494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  50.64 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.48 
 
 		 479 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.65 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  45.06 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.79 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  44.75 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  47.97 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.28 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.67 
 
 		 498 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.71 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  45.24 
 
 		 487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.73 
 
 		 506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  44.49 
 
 		 472 aa  357  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.83 
 
 		 465 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  43.83 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.84 
 
 		 496 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  44.32 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.01 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  44.03 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.52 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  43.63 
 
 		 468 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 		 479 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  40.81 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>