More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0442 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
478 aa  952    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.53 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.74 
 
 
471 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.63 
 
 
481 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  51.99 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  52.92 
 
 
475 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  53.62 
 
 
478 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  59.28 
 
 
484 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  55.2 
 
 
468 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  53.28 
 
 
475 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  52.44 
 
 
470 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.32 
 
 
470 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  52.44 
 
 
470 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.04 
 
 
474 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  53 
 
 
468 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  53.85 
 
 
475 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  52.32 
 
 
480 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.84 
 
 
477 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  53.35 
 
 
489 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  51.92 
 
 
475 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  52.54 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  54.78 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  52.41 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  53.93 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  51.48 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  55.41 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  53.72 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.66 
 
 
473 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  53.45 
 
 
473 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.45 
 
 
473 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.45 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  52.1 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  53.02 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.45 
 
 
473 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.45 
 
 
472 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.11 
 
 
475 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  57.39 
 
 
469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  53.35 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  48.51 
 
 
469 aa  450  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5003  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.7 
 
 
477 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.541494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.51 
 
 
519 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3672  FAD linked oxidase domain protein  55.77 
 
 
484 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  0.686407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  52.8 
 
 
472 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  50.74 
 
 
474 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  49.26 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  51.06 
 
 
472 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.11 
 
 
474 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.36 
 
 
481 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3474  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.56 
 
 
483 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3782  FAD linked oxidase domain protein  55.97 
 
 
483 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
489 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  48.2 
 
 
477 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
474 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  52.43 
 
 
524 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  52.64 
 
 
473 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.85 
 
 
479 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.65 
 
 
472 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.85 
 
 
483 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  49.48 
 
 
477 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.16 
 
 
476 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  53.81 
 
 
471 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  51.05 
 
 
464 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.97 
 
 
472 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.47 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  47.11 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 
472 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  50.84 
 
 
465 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.96 
 
 
464 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.19 
 
 
502 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  48.83 
 
 
473 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.76 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  47.7 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.68 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  46.86 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
489 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.47 
 
 
462 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.37 
 
 
498 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  52.12 
 
 
468 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4478  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.71 
 
 
465 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408304  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  47.27 
 
 
487 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.17 
 
 
475 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.21 
 
 
465 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.73 
 
 
473 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  45.88 
 
 
472 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  50.42 
 
 
465 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.98 
 
 
496 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2327  FAD linked oxidase-like  48.63 
 
 
471 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352966  normal  0.977128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.08 
 
 
506 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.22 
 
 
471 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  44.28 
 
 
474 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.41 
 
 
479 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.55 
 
 
480 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.47 
 
 
475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  46 
 
 
472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>