More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4472 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
464 aa  901    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  85.93 
 
 
464 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  70.77 
 
 
465 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.11 
 
 
465 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.42 
 
 
462 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  70.11 
 
 
465 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  54.7 
 
 
468 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  50.43 
 
 
468 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  49.47 
 
 
475 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.01 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.82 
 
 
471 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  50.95 
 
 
489 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  47.1 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  49.02 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  49.23 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  48.09 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  48.19 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  50.55 
 
 
470 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  47.1 
 
 
470 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.87 
 
 
476 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  48.39 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.42 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  49.03 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  50.96 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.81 
 
 
474 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.81 
 
 
470 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  46.79 
 
 
474 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  46.01 
 
 
477 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  47.52 
 
 
475 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  46.65 
 
 
489 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  53.05 
 
 
469 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.17 
 
 
481 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.12 
 
 
472 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  46.38 
 
 
480 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.95 
 
 
483 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  45.96 
 
 
475 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.82 
 
 
475 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.21 
 
 
479 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.15 
 
 
519 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  47.36 
 
 
477 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  45.94 
 
 
476 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  47.84 
 
 
474 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.53 
 
 
474 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.21 
 
 
498 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  47.32 
 
 
473 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  47.6 
 
 
472 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.46 
 
 
506 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.78 
 
 
477 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 
480 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.72 
 
 
473 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  45.42 
 
 
480 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.94 
 
 
473 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.91 
 
 
472 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.9 
 
 
474 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  47.16 
 
 
472 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  45.38 
 
 
476 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.51 
 
 
472 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.36 
 
 
491 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.46 
 
 
472 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.82 
 
 
472 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  44.94 
 
 
475 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.96 
 
 
502 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.07 
 
 
473 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  45.85 
 
 
473 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.85 
 
 
473 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  48.09 
 
 
484 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  45.32 
 
 
478 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  44.89 
 
 
475 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  48.71 
 
 
478 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  45.65 
 
 
473 aa  363  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  46.07 
 
 
472 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  48.05 
 
 
472 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  46.52 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.04 
 
 
473 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 
487 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  46.68 
 
 
471 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.71 
 
 
475 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  47.16 
 
 
473 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  46.94 
 
 
524 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.54 
 
 
496 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  44.77 
 
 
463 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  39.7 
 
 
469 aa  349  5e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.42 
 
 
483 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  49.14 
 
 
468 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  42.21 
 
 
484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  44.95 
 
 
474 aa  343  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.73 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4312  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.61 
 
 
466 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4872  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 
481 aa  330  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.66 
 
 
480 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4478  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.38 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408304  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3672  FAD linked oxidase domain protein  46.5 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  0.686407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  42.61 
 
 
463 aa  326  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  38.43 
 
 
523 aa  322  8e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>