More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4968 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.93 
 
 
480 aa  770    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  88.14 
 
 
489 aa  855    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  78.46 
 
 
477 aa  758    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  72.38 
 
 
477 aa  695    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  76.71 
 
 
473 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.71 
 
 
474 aa  850    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
476 aa  968    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.44 
 
 
502 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.65 
 
 
472 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1420  putative oxidoreductase protein  68.66 
 
 
468 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00835956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.49 
 
 
473 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.64 
 
 
472 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  61.06 
 
 
473 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.06 
 
 
473 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.85 
 
 
473 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  60.43 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.64 
 
 
473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.34 
 
 
475 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  59.83 
 
 
472 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  60.04 
 
 
472 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  59.87 
 
 
473 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  60.55 
 
 
474 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  58.94 
 
 
470 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
524 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  59.45 
 
 
473 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.35 
 
 
472 aa  534  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.6 
 
 
472 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  57.11 
 
 
470 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  57.23 
 
 
470 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  58.94 
 
 
472 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  55.44 
 
 
472 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.53 
 
 
519 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  53.12 
 
 
468 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  50.53 
 
 
470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  50.53 
 
 
470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.53 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.97 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  51.8 
 
 
468 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 
471 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  47.56 
 
 
475 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  54.29 
 
 
469 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  47.13 
 
 
478 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  48.83 
 
 
475 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.48 
 
 
477 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  50.32 
 
 
475 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  49.04 
 
 
475 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0390  FAD-binding protein  45.42 
 
 
469 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  47.66 
 
 
476 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.04 
 
 
474 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.71 
 
 
489 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  51.27 
 
 
484 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  48.61 
 
 
489 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.79 
 
 
481 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  48.2 
 
 
474 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.26 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.04 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  46.7 
 
 
480 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  45.44 
 
 
476 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  49.16 
 
 
478 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.58 
 
 
483 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  47.45 
 
 
478 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
478 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  49.05 
 
 
471 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  47.56 
 
 
470 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  48.2 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  47.76 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  47.36 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.09 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.86 
 
 
475 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.28 
 
 
470 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  44.14 
 
 
480 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  46.17 
 
 
489 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  46.4 
 
 
483 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.87 
 
 
464 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  44.2 
 
 
471 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 
465 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5003  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
477 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.541494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  43.62 
 
 
474 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.59 
 
 
479 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.44 
 
 
496 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  44.54 
 
 
463 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.34 
 
 
480 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  45.78 
 
 
465 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.58 
 
 
465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.47 
 
 
506 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.53 
 
 
473 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3672  FAD linked oxidase domain protein  45.63 
 
 
484 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  0.686407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2127  putative oxidoreductase  42.77 
 
 
465 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421585  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.43 
 
 
498 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4312  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.98 
 
 
466 aa  353  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0979  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.87 
 
 
491 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  42.53 
 
 
487 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2327  FAD linked oxidase-like  45.5 
 
 
471 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352966  normal  0.977128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3474  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.06 
 
 
483 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3782  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 
483 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  0.461102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>