More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1608 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 468 aa  942    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.95 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  52.49 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.32 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.97 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.1 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  52.6 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.24 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  53.9 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.29 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  52.71 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.09 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.71 
 
 		 476 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.08 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.55 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.71 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  50.55 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.49 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  52.59 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  52.38 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.32 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.66 
 
 		 451 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  51.08 
 
 		 470 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.5 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.79 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.12 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  47.01 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.6 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  45.79 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  43.63 
 
 		 489 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  43.95 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  42.06 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.72 
 
 		 475 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.04 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.78 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 465 aa  339  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  42.41 
 
 		 477 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  41.33 
 
 		 480 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  42.92 
 
 		 474 aa  336  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  43.33 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  43.56 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.56 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 		 489 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  42.83 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 474 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.49 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  43.79 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.61 
 
 		 476 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.11 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  43.12 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.28 
 
 		 473 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.69 
 
 		 478 aa  329  8e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.28 
 
 		 472 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  43.31 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  40.51 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  45.56 
 
 		 478 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  43.72 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.6 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  42.63 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.59 
 
 		 468 aa  322  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  42.63 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.63 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.95 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  41.63 
 
 		 470 aa  315  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.34 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.05 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  42.89 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  44 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.22 
 
 		 472 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.07 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.47 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.66 
 
 		 519 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  43.78 
 
 		 524 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.29 
 
 		 474 aa  313  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.54 
 
 		 462 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  40.68 
 
 		 478 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  43.25 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  41.91 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.07 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  41.4 
 
 		 470 aa  309  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.55 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  39.74 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.54 
 
 		 462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  37.74 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  41.08 
 
 		 472 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.62 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  43.94 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.87 
 
 		 472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>