More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1817 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  94.04 
 
 
470 aa  870    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  100 
 
 
470 aa  948    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.66 
 
 
467 aa  777    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.29 
 
 
462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.23 
 
 
456 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.1 
 
 
470 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.23 
 
 
464 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  49.02 
 
 
481 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  52.38 
 
 
468 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.13 
 
 
458 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  49.9 
 
 
476 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.9 
 
 
476 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.31 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.05 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  50.32 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.77 
 
 
473 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.93 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.66 
 
 
462 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.88 
 
 
476 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  47.26 
 
 
471 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.03 
 
 
451 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  45.34 
 
 
469 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  45.65 
 
 
469 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  44.75 
 
 
447 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 
471 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.85 
 
 
468 aa  345  8.999999999999999e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.35 
 
 
457 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  44.14 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  43.45 
 
 
460 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 
474 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.79 
 
 
475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  40.29 
 
 
470 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 
472 aa  300  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  41.28 
 
 
474 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.61 
 
 
475 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  42.76 
 
 
489 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.96 
 
 
475 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  42.05 
 
 
473 aa  297  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  44.87 
 
 
460 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  40.13 
 
 
477 aa  297  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  40.64 
 
 
473 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  40.64 
 
 
473 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.64 
 
 
473 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.64 
 
 
473 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.26 
 
 
483 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
476 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.64 
 
 
472 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 
470 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.48 
 
 
462 aa  292  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  40.23 
 
 
472 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  40.23 
 
 
472 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.71 
 
 
462 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.21 
 
 
473 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  39.66 
 
 
489 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 
470 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.52 
 
 
470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.21 
 
 
473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.1 
 
 
481 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.45 
 
 
474 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  39.79 
 
 
472 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  42 
 
 
474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  39.79 
 
 
472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  42 
 
 
472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  40.88 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  40.45 
 
 
463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  40.85 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.92 
 
 
502 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.03 
 
 
480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  40.9 
 
 
470 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.04 
 
 
519 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40 
 
 
468 aa  282  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 
462 aa  282  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.34 
 
 
465 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.28 
 
 
478 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 
476 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  43.65 
 
 
478 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.78 
 
 
475 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.16 
 
 
472 aa  281  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.92 
 
 
470 aa  280  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  40.3 
 
 
489 aa  279  6e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  40.91 
 
 
476 aa  279  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  41.9 
 
 
464 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  35.67 
 
 
537 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.28 
 
 
472 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  40.92 
 
 
470 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  40.69 
 
 
470 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  39.59 
 
 
474 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  36.6 
 
 
557 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
524 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.49 
 
 
475 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  41.06 
 
 
473 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  38.56 
 
 
477 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>