More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3923 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  904    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  96.09 
 
 
460 aa  828    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  43.45 
 
 
470 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.24 
 
 
463 aa  316  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  42.01 
 
 
471 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  41.43 
 
 
469 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  42.2 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  42.41 
 
 
468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.54 
 
 
457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.15 
 
 
476 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.15 
 
 
473 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.7 
 
 
467 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  42.12 
 
 
476 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.12 
 
 
476 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.69 
 
 
475 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  41.37 
 
 
468 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 
475 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  41.63 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  41.31 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.72 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.12 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.09 
 
 
483 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  41.31 
 
 
475 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.15 
 
 
469 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  41.14 
 
 
472 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.22 
 
 
464 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 
468 aa  275  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.41 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.91 
 
 
489 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  41.12 
 
 
478 aa  272  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  39.95 
 
 
480 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  41.63 
 
 
487 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.59 
 
 
470 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  41.27 
 
 
481 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.72 
 
 
481 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 
471 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.81 
 
 
462 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 
489 aa  269  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.84 
 
 
456 aa  269  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.94 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  39.79 
 
 
474 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.15 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  43.06 
 
 
464 aa  267  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.33 
 
 
473 aa  267  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  39.04 
 
 
557 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.04 
 
 
447 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.05 
 
 
472 aa  265  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  38.51 
 
 
470 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 
519 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
473 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.89 
 
 
506 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.25 
 
 
468 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.08 
 
 
462 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  36.81 
 
 
523 aa  262  8e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  39.77 
 
 
473 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.77 
 
 
473 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.77 
 
 
473 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 
470 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 
458 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.77 
 
 
472 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  40.65 
 
 
478 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  40 
 
 
473 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  41.45 
 
 
465 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  38.79 
 
 
474 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  38.92 
 
 
471 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  38.89 
 
 
470 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.98 
 
 
462 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  37.85 
 
 
462 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.71 
 
 
464 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  38.39 
 
 
480 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.82 
 
 
472 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  38.85 
 
 
470 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 
476 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.34 
 
 
481 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.81 
 
 
470 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.2 
 
 
475 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  41.92 
 
 
465 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.92 
 
 
465 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  36.85 
 
 
537 aa  252  9.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
489 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  40.57 
 
 
478 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 
477 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  39.12 
 
 
470 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
524 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  39.33 
 
 
472 aa  250  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  37.81 
 
 
476 aa  250  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  35.92 
 
 
484 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  40.79 
 
 
473 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
473 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
473 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
473 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
473 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  40.84 
 
 
473 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  37.96 
 
 
472 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 
472 aa  249  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 
489 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  39.21 
 
 
473 aa  247  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.89 
 
 
462 aa  247  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>