More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0121 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  84.66 
 
 		 476 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.87 
 
 		 476 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 476 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.39 
 
 		 476 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  87.17 
 
 		 476 aa  804    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  95.8 
 
 		 473 aa  883    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.17 
 
 		 476 aa  804    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  53.86 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.11 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.12 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  50 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  49.47 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.21 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.59 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  48.07 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.7 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.98 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.47 
 
 		 462 aa  358  9e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.91 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.06 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  46.64 
 
 		 471 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  47.64 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  45 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  46.34 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.65 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.18 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.17 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.83 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.3 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  40.21 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  40.47 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  43.93 
 
 		 468 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 457 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.33 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.15 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  40.04 
 
 		 470 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  39.21 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  43.72 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.35 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  40.34 
 
 		 480 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  39.96 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.89 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.52 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38.98 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  41.96 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.53 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  39.28 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  40.21 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  40.67 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  43.15 
 
 		 460 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  39.92 
 
 		 478 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  41.63 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  43.8 
 
 		 464 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  41.96 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  39.06 
 
 		 477 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  39.39 
 
 		 474 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  40.26 
 
 		 472 aa  279  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.44 
 
 		 474 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.92 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.21 
 
 		 468 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  37.69 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  40.62 
 
 		 475 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  39.15 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  40.28 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 		 489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.38 
 
 		 464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  39.11 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  39.59 
 
 		 477 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  39.11 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  45.85 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 		 474 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.89 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  39.69 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  42.47 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 		 475 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.68 
 
 		 473 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.56 
 
 		 519 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.98 
 
 		 498 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.24 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 		 472 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.25 
 
 		 473 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  41.03 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.46 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  43.6 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.86 
 
 		 523 aa  267  2.9999999999999995e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.27 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.2 
 
 		 480 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>