More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0734 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  890    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  50.66 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.49 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  50.11 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 		 476 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  49.17 
 
 		 469 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.91 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.2 
 
 		 476 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  48.47 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  47.3 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  48.03 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.3 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.35 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.06 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.18 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 		 462 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  47.57 
 
 		 481 aa  362  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.21 
 
 		 468 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  44.75 
 
 		 469 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.2 
 
 		 476 aa  359  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.38 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  46.71 
 
 		 470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.01 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.66 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.96 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.9 
 
 		 457 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.79 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  44.03 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  39.34 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  39.92 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.77 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  37.88 
 
 		 475 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  37.28 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  38.61 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.25 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  41.1 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3631  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.57 
 
 		 463 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  39.49 
 
 		 489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.74 
 
 		 483 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.86 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.9 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.75 
 
 		 523 aa  282  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.86 
 
 		 476 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  42.72 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  37.55 
 
 		 480 aa  279  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  43.3 
 
 		 460 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.31 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  39.78 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  36.79 
 
 		 477 aa  277  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.63 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 		 473 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  37.5 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 472 aa  275  9e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4473  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 		 450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.38 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  39.46 
 
 		 472 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 		 468 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.06 
 
 		 464 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  36.64 
 
 		 537 aa  271  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.87 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  33.78 
 
 		 557 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  42.09 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  37.1 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  38.06 
 
 		 463 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  39.08 
 
 		 473 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  37.23 
 
 		 470 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.64 
 
 		 481 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  38.88 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  37.72 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 472 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  37.13 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10162  oxidoreductase  39.14 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  36.7 
 
 		 470 aa  266  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.95 
 
 		 475 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  36.7 
 
 		 470 aa  266  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.77 
 
 		 474 aa  266  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  39.07 
 
 		 473 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  38.85 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  38.85 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  38.85 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  38.85 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  38.48 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  38.85 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  38.45 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.98 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  38.64 
 
 		 524 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 502 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  38.14 
 
 		 473 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>