More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3631 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3631  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
463 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.27 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  44.31 
 
 
471 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.57 
 
 
451 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.88 
 
 
470 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.08 
 
 
468 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  42.05 
 
 
481 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.28 
 
 
469 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  42.24 
 
 
469 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  41.53 
 
 
469 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  42.02 
 
 
470 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  41.15 
 
 
470 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  41.78 
 
 
470 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.02 
 
 
476 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.59 
 
 
470 aa  274  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.41 
 
 
462 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.02 
 
 
473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  42.92 
 
 
468 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  40.05 
 
 
480 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  38.36 
 
 
475 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.9 
 
 
467 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.08 
 
 
476 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.51 
 
 
489 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.57 
 
 
465 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  40.93 
 
 
476 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.93 
 
 
476 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  39.39 
 
 
471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  39.51 
 
 
475 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  41.26 
 
 
476 aa  259  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.1 
 
 
476 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.09 
 
 
447 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  39.43 
 
 
472 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  39.43 
 
 
472 aa  256  6e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 
462 aa  256  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 
468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.16 
 
 
462 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10162  oxidoreductase  40.9 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  37.61 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.83 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.55 
 
 
462 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  38.62 
 
 
484 aa  249  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.73 
 
 
519 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
463 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  36.87 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 
462 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  38.22 
 
 
474 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 
489 aa  246  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 
474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 
481 aa  244  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 
489 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.86 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  38.99 
 
 
460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  42.69 
 
 
464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  37.73 
 
 
470 aa  243  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 
475 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  37.73 
 
 
470 aa  243  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 
476 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  37.75 
 
 
463 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  38.14 
 
 
472 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.5 
 
 
473 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
477 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 
473 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 
472 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.27 
 
 
470 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  36.11 
 
 
477 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.37 
 
 
475 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  40.56 
 
 
472 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 
472 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  39.07 
 
 
473 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  36.68 
 
 
478 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.14 
 
 
473 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 
473 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  42.72 
 
 
465 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4473  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.63 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  33.19 
 
 
523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  39.68 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.32 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  34.65 
 
 
470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
470 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  36.13 
 
 
474 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  39.3 
 
 
473 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 
480 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 
504 aa  229  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.78 
 
 
481 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.47 
 
 
467 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  37.53 
 
 
472 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.74 
 
 
472 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
524 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  30.7 
 
 
480 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  38.05 
 
 
476 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
473 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>