More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2071 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  85.44 
 
 		 469 aa  828    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  82.83 
 
 		 471 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 469 aa  954    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.96 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.42 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  53.9 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.84 
 
 		 470 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.36 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  48.49 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.46 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.94 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.12 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.32 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  45.3 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.35 
 
 		 462 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.36 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 465 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  44.92 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.92 
 
 		 476 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 		 456 aa  329  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  44.91 
 
 		 476 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.64 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.64 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.94 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  46.63 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.06 
 
 		 476 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.92 
 
 		 462 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.48 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.45 
 
 		 476 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  42.13 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  40.68 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 474 aa  306  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.01 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  41.43 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  40.98 
 
 		 462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.7 
 
 		 471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  42.16 
 
 		 468 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.06 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.92 
 
 		 475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 475 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.55 
 
 		 476 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  40.65 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  40.9 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.93 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.57 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  38.11 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  39.72 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  36.32 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  39.72 
 
 		 472 aa  296  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.75 
 
 		 472 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  40.3 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  39.45 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.84 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.94 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 		 523 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.06 
 
 		 489 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  40.37 
 
 		 473 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.37 
 
 		 473 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  37.39 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.69 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  38.17 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.73 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.69 
 
 		 473 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.48 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  39.03 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.96 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.83 
 
 		 472 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  42.63 
 
 		 478 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  40.52 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.59 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  41.43 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.4 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.84 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.62 
 
 		 473 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.7 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  39.68 
 
 		 473 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  39.26 
 
 		 470 aa  282  9e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  39.72 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.62 
 
 		 473 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  35.26 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  39.91 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  35.26 
 
 		 464 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  40.14 
 
 		 493 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.68 
 
 		 462 aa  280  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  36.75 
 
 		 557 aa  279  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.06 
 
 		 502 aa  279  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  36.68 
 
 		 568 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 		 479 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  40.37 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  40.37 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  40.37 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  40.37 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  39.39 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  40.37 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>