More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5154 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 455 aa  945    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.83 
 
 		 463 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  84.26 
 
 		 464 aa  804    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  85.18 
 
 		 472 aa  814    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  96.26 
 
 		 465 aa  918    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  86.95 
 
 		 472 aa  832    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.1 
 
 		 467 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  86.92 
 
 		 464 aa  833    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  99.34 
 
 		 473 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  86.25 
 
 		 463 aa  826    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  87.14 
 
 		 464 aa  835    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  95.16 
 
 		 473 aa  911    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  66.74 
 
 		 480 aa  631  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  66.52 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  64.97 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  64.73 
 
 		 485 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.95 
 
 		 504 aa  611  1e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  55.06 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  55.06 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.35 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  52.8 
 
 		 462 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  53.79 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  46.05 
 
 		 463 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.78 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  37.98 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.91 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  38.04 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 		 468 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  37.53 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  37.22 
 
 		 489 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  37.91 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 		 475 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  39.81 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.37 
 
 		 472 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  38.03 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  35.76 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  37.42 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.42 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  37.55 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.08 
 
 		 472 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  37.97 
 
 		 480 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.2 
 
 		 473 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.05 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.68 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  36.9 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.64 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.68 
 
 		 473 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  37.11 
 
 		 477 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.15 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  35.75 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  36.61 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 		 489 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.15 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.31 
 
 		 462 aa  279  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  36.36 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  34.56 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.76 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  35.59 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.02 
 
 		 462 aa  276  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 471 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  34.55 
 
 		 568 aa  276  7e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  35.02 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  37.12 
 
 		 473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.64 
 
 		 477 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  35.46 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  36.82 
 
 		 470 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  34.14 
 
 		 537 aa  271  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.31 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  35.01 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.46 
 
 		 472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.78 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  37.04 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 474 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  36.42 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 		 470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.36 
 
 		 481 aa  269  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.68 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.99 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  33.33 
 
 		 557 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  35.35 
 
 		 469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  35.44 
 
 		 472 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.51 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  36.94 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.84 
 
 		 475 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 		 472 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.96 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.16 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.66 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2796  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 498 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  34.2 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  36.46 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  35.68 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>