More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89565 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  100 
 
 		 523 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  59.54 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  56.63 
 
 		 537 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  55.21 
 
 		 568 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  46.89 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20192  d-lactate dehydrogenase  41.52 
 
 		 507 aa  395  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  39.29 
 
 		 475 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.61 
 
 		 472 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.51 
 
 		 479 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.71 
 
 		 489 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  37.61 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.64 
 
 		 475 aa  321  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  37.19 
 
 		 475 aa  319  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.52 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.92 
 
 		 464 aa  316  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  38.17 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.09 
 
 		 470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  38.67 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  36.98 
 
 		 484 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.46 
 
 		 470 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  37.21 
 
 		 480 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38.46 
 
 		 470 aa  312  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  37.94 
 
 		 464 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.29 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  38.46 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 464 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.37 
 
 		 476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  37.19 
 
 		 474 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  36.83 
 
 		 478 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.7 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  38.53 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  36.29 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  37.73 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 		 462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.72 
 
 		 468 aa  306  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.31 
 
 		 477 aa  306  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  36.71 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.42 
 
 		 473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.24 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  36.83 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 		 470 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.85 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  35.5 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  35.71 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  36.44 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.99 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.43 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  35.89 
 
 		 477 aa  300  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.82 
 
 		 481 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  35.23 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.15 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 524 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 		 474 aa  299  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  35.81 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.26 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  38.53 
 
 		 475 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.93 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  36.54 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.23 
 
 		 483 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  38.81 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  35.45 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.32 
 
 		 469 aa  290  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  38.11 
 
 		 469 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  36.54 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.76 
 
 		 474 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.09 
 
 		 467 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  33.48 
 
 		 462 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  34.7 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  35.99 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 		 468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.79 
 
 		 463 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 		 465 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  34.71 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.42 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  35.42 
 
 		 489 aa  283  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  36.79 
 
 		 476 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  34.79 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 506 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  34.98 
 
 		 478 aa  280  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.03 
 
 		 472 aa  280  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>