More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3002 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  914    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.12 
 
 
469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  57.31 
 
 
471 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  53.68 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  54.94 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.24 
 
 
463 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.24 
 
 
464 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  49.12 
 
 
481 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  50.32 
 
 
468 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.48 
 
 
470 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.55 
 
 
458 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.67 
 
 
457 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.4 
 
 
470 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  47.91 
 
 
470 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  47.36 
 
 
470 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.94 
 
 
462 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.29 
 
 
467 aa  359  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.23 
 
 
451 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.47 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  47.28 
 
 
476 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.28 
 
 
476 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.12 
 
 
462 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.65 
 
 
473 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.72 
 
 
476 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.29 
 
 
476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  45.99 
 
 
476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 
465 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.77 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.76 
 
 
447 aa  316  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.8 
 
 
471 aa  315  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  43.87 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.42 
 
 
464 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.86 
 
 
481 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  43.38 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  44.35 
 
 
464 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  46.7 
 
 
468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.45 
 
 
462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.77 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  42.46 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 
519 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 
477 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  41.58 
 
 
470 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  42.39 
 
 
489 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  41.14 
 
 
474 aa  300  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  41.85 
 
 
489 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  44.16 
 
 
465 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  43.01 
 
 
489 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  36.49 
 
 
523 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 
470 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.07 
 
 
489 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.8 
 
 
474 aa  296  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.36 
 
 
481 aa  294  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  40.52 
 
 
472 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  40.52 
 
 
472 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.47 
 
 
475 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.88 
 
 
468 aa  292  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.19 
 
 
462 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  42.11 
 
 
470 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  41.51 
 
 
462 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  41.19 
 
 
478 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.18 
 
 
476 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  36.55 
 
 
557 aa  290  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.55 
 
 
472 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.58 
 
 
475 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  42.92 
 
 
474 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.91 
 
 
472 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  40.38 
 
 
477 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  43.68 
 
 
484 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.97 
 
 
462 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.18 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  41.7 
 
 
472 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  41.4 
 
 
463 aa  286  5e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  41.45 
 
 
474 aa  286  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.51 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  43.22 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 
480 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  44.37 
 
 
465 aa  282  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  42.59 
 
 
480 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3631  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.1 
 
 
463 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  40.35 
 
 
493 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  41.47 
 
 
476 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.9 
 
 
474 aa  279  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.06 
 
 
477 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  37.9 
 
 
471 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  41.74 
 
 
460 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 
483 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  42.53 
 
 
472 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  40.82 
 
 
487 aa  277  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  42.58 
 
 
478 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.94 
 
 
473 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
473 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  39.24 
 
 
480 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.66 
 
 
472 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
473 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  33.69 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2364  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.79 
 
 
496 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.72 
 
 
473 aa  273  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5468  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.29 
 
 
473 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00404471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>