More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0135 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.03 
 
 
476 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  89.71 
 
 
476 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.39 
 
 
476 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
476 aa  944    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  96.43 
 
 
476 aa  913    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  88.62 
 
 
473 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  96.43 
 
 
476 aa  913    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  52.06 
 
 
468 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 
470 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.21 
 
 
456 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.05 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  50.31 
 
 
470 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  49.9 
 
 
470 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.28 
 
 
470 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.79 
 
 
458 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 
467 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  48.46 
 
 
481 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.75 
 
 
464 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
462 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.2 
 
 
451 aa  359  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.06 
 
 
462 aa  349  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.75 
 
 
469 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  45.2 
 
 
471 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  45.83 
 
 
471 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.29 
 
 
468 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  44.06 
 
 
469 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  43.93 
 
 
469 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  43.62 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.21 
 
 
447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 
465 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.3 
 
 
471 aa  299  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  44.63 
 
 
468 aa  297  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.25 
 
 
472 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.31 
 
 
481 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  38.22 
 
 
470 aa  293  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.69 
 
 
483 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.21 
 
 
481 aa  292  8e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.95 
 
 
457 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
477 aa  289  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  39.82 
 
 
476 aa  289  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  43.78 
 
 
484 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38 
 
 
470 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 
470 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  44.06 
 
 
464 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  41.94 
 
 
489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.91 
 
 
468 aa  282  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 
475 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  41.28 
 
 
477 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 
470 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.57 
 
 
470 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  40.55 
 
 
480 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  39.96 
 
 
470 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  39.23 
 
 
470 aa  279  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  39.71 
 
 
475 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  38.77 
 
 
474 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  41.05 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.07 
 
 
489 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  39.36 
 
 
478 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.63 
 
 
462 aa  273  6e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.63 
 
 
462 aa  272  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.94 
 
 
472 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
489 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.37 
 
 
477 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.19 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.43 
 
 
519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  38.66 
 
 
475 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3118  FAD linked oxidase domain protein  45.73 
 
 
469 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.624021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  39.61 
 
 
472 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.71 
 
 
472 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  42.01 
 
 
460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 
480 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 
474 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.95 
 
 
473 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 
473 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 
472 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 
473 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.12 
 
 
473 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.73 
 
 
473 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  41.26 
 
 
473 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.09 
 
 
475 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  40.09 
 
 
472 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 
502 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  39.62 
 
 
474 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 
537 aa  265  8.999999999999999e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.76 
 
 
472 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  38.23 
 
 
478 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.58 
 
 
474 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
473 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  39.66 
 
 
475 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  43.47 
 
 
465 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  39 
 
 
478 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
462 aa  263  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  34.68 
 
 
485 aa  262  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  41.24 
 
 
472 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.51 
 
 
472 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  39.83 
 
 
473 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>