More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6649 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
471 aa  961    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.35 
 
 
458 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.91 
 
 
470 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.42 
 
 
464 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.35 
 
 
467 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  45.79 
 
 
468 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  44.59 
 
 
470 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  44.52 
 
 
470 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  44.83 
 
 
481 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.61 
 
 
470 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.48 
 
 
469 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  45 
 
 
471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  44.16 
 
 
447 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.2 
 
 
476 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.83 
 
 
462 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  44.76 
 
 
476 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.92 
 
 
463 aa  346  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  45 
 
 
476 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  46.88 
 
 
469 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  46.39 
 
 
476 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.39 
 
 
476 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  46.63 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.72 
 
 
456 aa  338  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.92 
 
 
473 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.86 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.64 
 
 
476 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.03 
 
 
451 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  38.82 
 
 
557 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.76 
 
 
475 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.31 
 
 
468 aa  306  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  37.99 
 
 
523 aa  300  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  41.28 
 
 
484 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  40.13 
 
 
489 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.12 
 
 
465 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  36.47 
 
 
537 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  39.77 
 
 
480 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  38.39 
 
 
568 aa  290  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.93 
 
 
478 aa  290  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  39.62 
 
 
477 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2485  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 
479 aa  286  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0928797  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  40.09 
 
 
475 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.8 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  36.8 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  39.11 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  40.79 
 
 
475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.9 
 
 
474 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  38 
 
 
472 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  37.11 
 
 
463 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.59 
 
 
476 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 
472 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.19 
 
 
457 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 
472 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  37.64 
 
 
472 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.53 
 
 
463 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  37.64 
 
 
472 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  33.62 
 
 
485 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  34.08 
 
 
455 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.82 
 
 
467 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.7 
 
 
480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  40 
 
 
472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.99 
 
 
475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  39.77 
 
 
470 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 
465 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.54 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 
504 aa  273  7e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39945  predicted protein  37.99 
 
 
493 aa  273  7e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  36.97 
 
 
474 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 
480 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  39.12 
 
 
470 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 
473 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  39.39 
 
 
474 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  33.69 
 
 
470 aa  270  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5386  FAD linked oxidase-like  33.7 
 
 
472 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  39.29 
 
 
477 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  36.48 
 
 
470 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.14 
 
 
472 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  36.91 
 
 
470 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  36.99 
 
 
462 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  33.18 
 
 
464 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  39.23 
 
 
473 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  33.41 
 
 
464 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.2 
 
 
519 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  39.78 
 
 
468 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  38.92 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.44 
 
 
481 aa  266  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  36.91 
 
 
470 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  32.63 
 
 
472 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  32.83 
 
 
463 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 
472 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.23 
 
 
473 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.94 
 
 
471 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  32.52 
 
 
480 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.41 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4691  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.23 
 
 
475 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  31.82 
 
 
480 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  37.02 
 
 
473 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.02 
 
 
473 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.1 
 
 
472 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3006  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.44 
 
 
474 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>