More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4540 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  917    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  53.76 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  54.23 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  52.65 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.46 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.65 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  51.99 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.11 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  51.72 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.73 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.78 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  53.46 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.21 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.96 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.89 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.87 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.75 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.96 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.46 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.97 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.1 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  47.63 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  44.42 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  46.7 
 
 		 469 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.42 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.72 
 
 		 465 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 		 471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.25 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  43.5 
 
 		 489 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.84 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.04 
 
 		 519 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  40.81 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.26 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.83 
 
 		 476 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  42.27 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.63 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  41.36 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  41.83 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.32 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  42.42 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  42.82 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.65 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.3 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.2 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.5 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.61 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.83 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  41.5 
 
 		 473 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.5 
 
 		 473 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.03 
 
 		 474 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  41.85 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  42.2 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.69 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  42.45 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  43.12 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  45.71 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  41.72 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.25 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  40.72 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  40.96 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  41.33 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  41.97 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  40.04 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.25 
 
 		 473 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  43.26 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.56 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.95 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  43.22 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  41.56 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  42.06 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.3 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.69 
 
 		 481 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  38.37 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.81 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.04 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5308  FAD linked oxidase domain protein  44.27 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.683932  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  37.3 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.1 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.76 
 
 		 471 aa  279  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0593  FAD linked oxidase domain protein  40.04 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  39.04 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  39.04 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  35.55 
 
 		 470 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  38.69 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0546  FAD linked oxidase domain protein  40.38 
 
 		 478 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  42.12 
 
 		 460 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  35.25 
 
 		 523 aa  276  5e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3146  FAD linked oxidase-like  40.42 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  40.37 
 
 		 476 aa  273  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6324  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0789269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2117  putative D-lactate dehydrogenase  41.67 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.36 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  41.14 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.61 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2818  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.89 
 
 		 467 aa  272  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  42.01 
 
 		 524 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  42.01 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>