More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0153 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
462 aa  932    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  54.29 
 
 
470 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  52.61 
 
 
470 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.99 
 
 
467 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  52.71 
 
 
468 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.46 
 
 
464 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.72 
 
 
470 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.42 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  50.87 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  50.44 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.44 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.11 
 
 
476 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.44 
 
 
473 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.88 
 
 
476 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
476 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.46 
 
 
456 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.45 
 
 
458 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.36 
 
 
462 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  46.19 
 
 
481 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.51 
 
 
463 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.45 
 
 
469 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 
451 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  48.35 
 
 
469 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  48.12 
 
 
471 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  44.22 
 
 
471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.38 
 
 
447 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  46.92 
 
 
469 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.38 
 
 
468 aa  342  9e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.83 
 
 
457 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  44.94 
 
 
468 aa  340  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  42.32 
 
 
470 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  42.89 
 
 
472 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  42.09 
 
 
474 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  41.83 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  41.68 
 
 
472 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  41.46 
 
 
463 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  44.04 
 
 
464 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  42.08 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  42.09 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  41.79 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.54 
 
 
475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  41.36 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.89 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  41.36 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.18 
 
 
519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  42.12 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.52 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  40.86 
 
 
475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 
489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  41.67 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
473 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.89 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.31 
 
 
475 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  36.97 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  41.22 
 
 
489 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  38.94 
 
 
470 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.12 
 
 
473 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
472 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.26 
 
 
474 aa  302  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  40.45 
 
 
462 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.55 
 
 
481 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.27 
 
 
462 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  36.54 
 
 
485 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  41.97 
 
 
473 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.4 
 
 
474 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
473 aa  300  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  44.57 
 
 
465 aa  300  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.13 
 
 
470 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.18 
 
 
465 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.21 
 
 
476 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.59 
 
 
462 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  41.24 
 
 
473 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.65 
 
 
472 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.62 
 
 
483 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  35.7 
 
 
480 aa  296  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.19 
 
 
473 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.08 
 
 
502 aa  296  5e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 
477 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 
465 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.46 
 
 
471 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
465 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.63 
 
 
478 aa  296  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  39.82 
 
 
462 aa  296  7e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
473 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.63 
 
 
489 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 
504 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.72 
 
 
472 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  38.09 
 
 
470 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  39.44 
 
 
480 aa  294  3e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  40.65 
 
 
474 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  36.3 
 
 
480 aa  294  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  37.02 
 
 
455 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  38.09 
 
 
470 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  40.9 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>