More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4846 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
470 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  94.04 
 
 
470 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  83.23 
 
 
467 aa  782    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.61 
 
 
462 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.46 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.03 
 
 
464 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  48.38 
 
 
481 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  51.08 
 
 
468 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  49.69 
 
 
476 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.69 
 
 
476 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  50.54 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.47 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.9 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.89 
 
 
473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.81 
 
 
470 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.15 
 
 
458 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.22 
 
 
463 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.49 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.88 
 
 
476 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.71 
 
 
469 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.12 
 
 
462 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  46.75 
 
 
471 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  44.86 
 
 
469 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.71 
 
 
451 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  44.35 
 
 
469 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.42 
 
 
468 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  44.52 
 
 
471 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  43.84 
 
 
447 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.94 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  44.2 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.95 
 
 
471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  41.06 
 
 
474 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  42.2 
 
 
460 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.26 
 
 
474 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  42.25 
 
 
475 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  42.25 
 
 
473 aa  295  9e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.06 
 
 
475 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  41.45 
 
 
475 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.03 
 
 
476 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  40.04 
 
 
473 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  42 
 
 
474 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.1 
 
 
472 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  40.42 
 
 
473 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.42 
 
 
473 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  38.73 
 
 
477 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  44.15 
 
 
460 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  38.98 
 
 
489 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 
472 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  41.72 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.63 
 
 
473 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.52 
 
 
470 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.77 
 
 
474 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  38.72 
 
 
470 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.56 
 
 
483 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  39.78 
 
 
470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0525  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.53 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  39.18 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  39.18 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.79 
 
 
462 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  41.58 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  41.38 
 
 
470 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  39.37 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  41.15 
 
 
470 aa  283  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  39.11 
 
 
472 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.04 
 
 
481 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  35.89 
 
 
537 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 
480 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0975  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
476 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  38.02 
 
 
462 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  39.82 
 
 
474 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2771  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.07 
 
 
502 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  hitchhiker  0.00649416 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  40.45 
 
 
463 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  39.92 
 
 
470 aa  279  9e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.42 
 
 
478 aa  279  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  36.45 
 
 
557 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  40.69 
 
 
480 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.71 
 
 
475 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  39.96 
 
 
473 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.28 
 
 
472 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  39.02 
 
 
477 aa  276  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 
489 aa  276  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  41.67 
 
 
464 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  38.22 
 
 
568 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.4 
 
 
472 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.26 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  39.55 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
477 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.76 
 
 
481 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.92 
 
 
475 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 
472 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1788  FAD linked oxidase domain protein  38.27 
 
 
462 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.53 
 
 
464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  39.83 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  36.45 
 
 
523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.28 
 
 
462 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>