More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3923  hypothetical protein  96.09 
 
 		 460 aa  835    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46140  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  904    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.340893  normal  0.162394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  44.74 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  41.79 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  44.15 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  41.43 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 		 469 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  43.29 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.77 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.36 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  42.01 
 
 		 476 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.01 
 
 		 476 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0111  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.3 
 
 		 451 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0177457  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.14 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3301  FAD linked oxidase-like  41.86 
 
 		 476 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  40.66 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.09 
 
 		 483 aa  286  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  41.45 
 
 		 475 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  40.38 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.48 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0135  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.55 
 
 		 476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0153  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.52 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  40.61 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  41.08 
 
 		 475 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4540  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.32 
 
 		 456 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.04 
 
 		 468 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0120  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 		 476 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.71 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5765  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.47 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.398015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  40.3 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1026  FAD linked oxidase-like  41.51 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00025239  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  39.67 
 
 		 489 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  39.28 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4275  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.64 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.89 
 
 		 470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4010  FAD linked oxidase-like  40.89 
 
 		 478 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  41.4 
 
 		 487 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5180  FAD linked oxidase domain protein  43.06 
 
 		 464 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.531552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.66 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  37.5 
 
 		 523 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8493  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0941328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  39.25 
 
 		 480 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  38.19 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  39.27 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1517  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.32 
 
 		 472 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.86 
 
 		 471 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0442  FAD linked oxidase-like  40.42 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2082  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.95 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0855218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.35 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.27 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  38.5 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4472  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 		 464 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1049  FAD linked oxidase-like protein  39.02 
 
 		 474 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.62 
 
 		 462 aa  259  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.93 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2978  FAD linked oxidase domain protein  41.22 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.93 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  37.08 
 
 		 537 aa  257  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.05 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  37.85 
 
 		 462 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  38.84 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.84 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 		 473 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  37.62 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3209  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.4 
 
 		 489 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  38.84 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  38.4 
 
 		 472 aa  253  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  37.96 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0158  FAD linked oxidase domain protein  41.45 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0830  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.46 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.889328  hitchhiker  0.000412529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0214  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.45 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4490  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.48 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  36.16 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5768  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.26 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.3 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 463 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  40.05 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.88 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5658  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.32 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.62 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0716  FAD linked oxidase-like  37.36 
 
 		 476 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570326  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  35.44 
 
 		 477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1667  FAD linked oxidase domain protein  37.04 
 
 		 470 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  hitchhiker  0.00657046 
 
 
-
 
NC_004310  BR0406  oxidoreductase, FAD-binding  35.15 
 
 		 470 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0415  oxidoreductase, FAD-binding  35.15 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06074  oxidoreductase  37.41 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000520479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00853  oxidoreductase  37.41 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00530367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  39.63 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  37.56 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6048  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  33.62 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  37.27 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  39.68 
 
 		 524 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  39.68 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>