More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0491 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  655    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1220  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.14 
 
 
324 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  38.34 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.91 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.45 
 
 
370 aa  117  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  25.96 
 
 
369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.96 
 
 
369 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.15 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.06 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.27 
 
 
358 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.98 
 
 
404 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.43 
 
 
362 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.11 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.99 
 
 
355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.79 
 
 
360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  24.93 
 
 
352 aa  109  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  35.26 
 
 
362 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  34.3 
 
 
437 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.32 
 
 
355 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.46 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  30 
 
 
409 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.52 
 
 
349 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.72 
 
 
362 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  24.64 
 
 
352 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.72 
 
 
362 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  31.22 
 
 
409 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  32.22 
 
 
409 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.62 
 
 
350 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.49 
 
 
350 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  28.06 
 
 
402 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.42 
 
 
351 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.69 
 
 
355 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0903  FAD linked oxidase domain protein  25.74 
 
 
359 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0158726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.37 
 
 
362 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
405 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.77 
 
 
377 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.62 
 
 
350 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.41 
 
 
359 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.62 
 
 
350 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.11 
 
 
376 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.6 
 
 
350 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.88 
 
 
357 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  31.62 
 
 
350 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.01 
 
 
362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.01 
 
 
362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.01 
 
 
362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.14 
 
 
356 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  26.95 
 
 
413 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  26.01 
 
 
376 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 
422 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.79 
 
 
428 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  27.64 
 
 
410 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.23 
 
 
350 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  27 
 
 
374 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 
395 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.02 
 
 
350 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  29.88 
 
 
350 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.05 
 
 
350 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  33.33 
 
 
352 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.87 
 
 
352 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  25.13 
 
 
426 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.61 
 
 
359 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.88 
 
 
350 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.54 
 
 
362 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.32 
 
 
354 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  23.95 
 
 
416 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.53 
 
 
459 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.12 
 
 
375 aa  99  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  31.85 
 
 
368 aa  99  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.09 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.23 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.95 
 
 
437 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.14 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  24.74 
 
 
425 aa  96.7  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 
436 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 
399 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
440 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.21 
 
 
377 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.08 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.43 
 
 
450 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
474 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.54 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  26.13 
 
 
412 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  23.85 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.25 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  31.25 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  31.25 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  24.84 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.9 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  31.25 
 
 
470 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  24.68 
 
 
440 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.9 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  30.9 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>