More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1428 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
362 aa  714    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.13 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  38.61 
 
 
395 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.75 
 
 
350 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.23 
 
 
382 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.79 
 
 
351 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.53 
 
 
374 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.96 
 
 
367 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.68 
 
 
349 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.81 
 
 
350 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.86 
 
 
362 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.96 
 
 
367 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.34 
 
 
348 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.16 
 
 
356 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 
422 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.57 
 
 
356 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  45.36 
 
 
368 aa  153  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.13 
 
 
350 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.88 
 
 
369 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.13 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  45.13 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  43.88 
 
 
369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  45.13 
 
 
350 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.13 
 
 
350 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.13 
 
 
350 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  37.19 
 
 
421 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.34 
 
 
350 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.92 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.62 
 
 
350 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.25 
 
 
362 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.62 
 
 
370 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  37.93 
 
 
410 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.11 
 
 
358 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.53 
 
 
351 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.27 
 
 
370 aa  150  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.87 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.15 
 
 
358 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  35.32 
 
 
406 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.36 
 
 
350 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.83 
 
 
362 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  41.74 
 
 
358 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
353 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.4 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.81 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.42 
 
 
377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.73 
 
 
352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.43 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.41 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.42 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.42 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.42 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.64 
 
 
372 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  38.26 
 
 
352 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.45 
 
 
360 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.45 
 
 
360 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.64 
 
 
377 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.52 
 
 
410 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.15 
 
 
358 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.2 
 
 
354 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.49 
 
 
358 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.02 
 
 
362 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  39.74 
 
 
424 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.4 
 
 
362 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.27 
 
 
403 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 
362 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  41.41 
 
 
376 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.33 
 
 
355 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.41 
 
 
375 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.11 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  40.3 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.96 
 
 
359 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  38.67 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.04 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.11 
 
 
352 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
405 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  46.49 
 
 
368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.33 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.12 
 
 
368 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  47.8 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.61 
 
 
354 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.98 
 
 
359 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  39.61 
 
 
409 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  39.61 
 
 
409 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  36.08 
 
 
405 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.46 
 
 
378 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.31 
 
 
364 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  48.43 
 
 
396 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  44 
 
 
358 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.43 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.5 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  35.05 
 
 
363 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>