More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3046 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  99.02 
 
 
409 aa  748    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
409 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  93.15 
 
 
409 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.9 
 
 
404 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  43.65 
 
 
395 aa  249  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  44.04 
 
 
424 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.24 
 
 
437 aa  221  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  36.23 
 
 
421 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  35.05 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 
428 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 
426 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  32.71 
 
 
444 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  45.45 
 
 
411 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
450 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.07 
 
 
407 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  34.68 
 
 
440 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 
440 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 
437 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  31.41 
 
 
454 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.92 
 
 
379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  33.58 
 
 
440 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  54.45 
 
 
437 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  34.09 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 
443 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 
436 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  48.89 
 
 
399 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.05 
 
 
876 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.24 
 
 
405 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  37.59 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.55 
 
 
357 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  32.2 
 
 
402 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.66 
 
 
410 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.34 
 
 
887 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.37 
 
 
460 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  32.51 
 
 
401 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  31.7 
 
 
399 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  40.51 
 
 
363 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.15 
 
 
396 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.67 
 
 
362 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.32 
 
 
362 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.55 
 
 
362 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  32.84 
 
 
410 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.18 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.18 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.18 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.01 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.16 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  35.22 
 
 
383 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.13 
 
 
466 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1220  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.11 
 
 
324 aa  119  9e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.82 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  34.33 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  31.18 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.05 
 
 
362 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
396 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.23 
 
 
358 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.15 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.05 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 
369 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  41.38 
 
 
376 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  33.42 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.67 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.12 
 
 
457 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.48 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.77 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.96 
 
 
459 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.14 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.3 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  39.18 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.23 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.75 
 
 
370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  30.84 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.11 
 
 
890 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.57 
 
 
377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.76 
 
 
372 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.17 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  38.02 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.02 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.36 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.17 
 
 
470 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  35.12 
 
 
413 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.17 
 
 
470 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 
474 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.51 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.5 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  35.86 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  32.45 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.24 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.21 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>