More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1916 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  71.33 
 
 
440 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
443 aa  911    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  32.86 
 
 
454 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  36.08 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
437 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  32.06 
 
 
431 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.87 
 
 
437 aa  199  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  30.57 
 
 
444 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 
440 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 
440 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  30.56 
 
 
421 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  31.33 
 
 
409 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  29.32 
 
 
425 aa  172  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 
428 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 
409 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  38.84 
 
 
395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.56 
 
 
379 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  34.85 
 
 
436 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  27.54 
 
 
395 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.28 
 
 
887 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  36.59 
 
 
409 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
450 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  32.21 
 
 
411 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  29.72 
 
 
411 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.88 
 
 
427 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  29.06 
 
 
437 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  39.45 
 
 
399 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  29.26 
 
 
452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  28.5 
 
 
410 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.71 
 
 
890 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.04 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  40.84 
 
 
399 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 
426 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  41.36 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.38 
 
 
370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.91 
 
 
358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.38 
 
 
370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  26.3 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.11 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.27 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  28.94 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.14 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.09 
 
 
374 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  28.44 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  28.44 
 
 
466 aa  126  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.65 
 
 
475 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.68 
 
 
876 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.84 
 
 
403 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.19 
 
 
466 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.36 
 
 
362 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.22 
 
 
357 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26 
 
 
457 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  25.81 
 
 
478 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.89 
 
 
362 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 
396 aa  122  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.76 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.25 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.2 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.02 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.33 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.61 
 
 
470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.1 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.27 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  33.33 
 
 
470 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.33 
 
 
470 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.86 
 
 
460 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  33.33 
 
 
470 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.33 
 
 
470 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.42 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.51 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.89 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.89 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.89 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  37.3 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.24 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.84 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.38 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.38 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.38 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.42 
 
 
460 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.42 
 
 
460 aa  119  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.89 
 
 
470 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.89 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.42 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  35 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.32 
 
 
457 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31583  mitochondrial D-lactate ferricytochrome c oxidoreductase  25.06 
 
 
612 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.37 
 
 
352 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 
396 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  27.98 
 
 
461 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.36 
 
 
459 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.72 
 
 
466 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  32.72 
 
 
362 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  32.46 
 
 
461 aa  117  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 
396 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.57 
 
 
377 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.12 
 
 
447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.08 
 
 
459 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.91 
 
 
372 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>