More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0187 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  100 
 
 		 399 aa  790    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  64.05 
 
 		 383 aa  484  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  53.69 
 
 		 460 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 440 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  33.5 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  37.43 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  33.9 
 
 		 431 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 		 437 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 454 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.11 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  26.83 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  40 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  39.46 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.42 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  32.22 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  33.47 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.86 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.13 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  30.69 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  41.26 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  42.7 
 
 		 413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  30.77 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  29.01 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.45 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.46 
 
 		 382 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 		 357 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  40.66 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  34.35 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  42.86 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  36.65 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  39.11 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.68 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.24 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  40.46 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.69 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  29.18 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  34.93 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  33.51 
 
 		 466 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.81 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  25.83 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.77 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.42 
 
 		 390 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.29 
 
 		 887 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  38.07 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  32.27 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.71 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  33.83 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.97 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.89 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.15 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.01 
 
 		 437 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.61 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.71 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.84 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  37.63 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  35.42 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.04 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.03 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  28.37 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  32.82 
 
 		 457 aa  96.3  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.52 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 		 460 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.41 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.38 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.44 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  34.67 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.1 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.38 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.38 
 
 		 876 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>