More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25811 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  100 
 
 		 460 aa  919    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  53.69 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  55.33 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  32.84 
 
 		 431 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  34.52 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  32.6 
 
 		 444 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 		 437 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 		 437 aa  167  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  30.83 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  35.21 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  30.43 
 
 		 440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.5 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  27.99 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  25.91 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.33 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  29.22 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  33.46 
 
 		 363 aa  117  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 		 436 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.4 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  29.56 
 
 		 424 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  40.56 
 
 		 437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  38.89 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  28.64 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  29.58 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.43 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.43 
 
 		 369 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  38.27 
 
 		 412 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  29.58 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  29.52 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.61 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  24 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  37.29 
 
 		 416 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  26.75 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.5 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.16 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  43.41 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.43 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.3 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  37.02 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  34.43 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.45 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.45 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  30.4 
 
 		 499 aa  97.4  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.33 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 		 469 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.96 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  37.19 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 		 353 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 		 469 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.73 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.96 
 
 		 474 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.11 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  28.95 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.01 
 
 		 362 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.76 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  28.25 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.08 
 
 		 349 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  28.25 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  28.25 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  29.6 
 
 		 395 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.1 
 
 		 358 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 485 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.51 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 		 377 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.51 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.33 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.92 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.92 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.92 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.51 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.88 
 
 		 362 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.92 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30 
 
 		 457 aa  91.7  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.24 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.67 
 
 		 362 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  29.24 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  35.96 
 
 		 381 aa  91.3  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.22 
 
 		 355 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 		 452 aa  90.5  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.36 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.36 
 
 		 374 aa  90.1  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.6 
 
 		 887 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.3 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>