More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1892 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
395 aa  780    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  36.34 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.81 
 
 
428 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  31.4 
 
 
421 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  33.67 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.37 
 
 
427 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
454 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  31.44 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.08 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  34.28 
 
 
395 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  32.24 
 
 
431 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  32.14 
 
 
424 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  32.04 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  34.6 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  34.29 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  31.8 
 
 
440 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  38.61 
 
 
362 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
440 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.89 
 
 
357 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  32.55 
 
 
437 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  36 
 
 
407 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
409 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
409 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  29.81 
 
 
443 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.38 
 
 
450 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 
436 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  31.96 
 
 
425 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.24 
 
 
405 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.21 
 
 
379 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  26.62 
 
 
454 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.35 
 
 
887 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  30.66 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
477 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.66 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.44 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  29.44 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.43 
 
 
469 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.18 
 
 
473 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.43 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  33.51 
 
 
399 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  29.11 
 
 
469 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.43 
 
 
469 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  29.11 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  33.02 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  32.8 
 
 
369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.95 
 
 
876 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  28.71 
 
 
456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.8 
 
 
369 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  26.86 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.4 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.11 
 
 
482 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  26.68 
 
 
468 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.97 
 
 
350 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.61 
 
 
890 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  28.5 
 
 
472 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.98 
 
 
374 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.05 
 
 
350 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.24 
 
 
462 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.88 
 
 
460 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 
485 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.3 
 
 
350 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.53 
 
 
370 aa  122  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.4 
 
 
460 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.76 
 
 
469 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.53 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.74 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  29.69 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  35.82 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.43 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.55 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.64 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.23 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  34.83 
 
 
475 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.21 
 
 
475 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0903  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 
359 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0158726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.81 
 
 
351 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.34 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.64 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.94 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  36.08 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.76 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  37.88 
 
 
469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  28.08 
 
 
412 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.52 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.83 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.16 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.11 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>