More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0903 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0903  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
359 aa  724    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0158726  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0552  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.31 
 
 
336 aa  153  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 
395 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 
327 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.42 
 
 
407 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  33.72 
 
 
436 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 
450 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 
474 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  32.02 
 
 
437 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.48 
 
 
447 aa  96.7  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  27.96 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 
472 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  29.59 
 
 
473 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  33.52 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  32.14 
 
 
495 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 
473 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 
474 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.85 
 
 
476 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  30.77 
 
 
474 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 
440 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  31.5 
 
 
472 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.81 
 
 
437 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 
454 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 
421 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.64 
 
 
474 aa  92.8  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.64 
 
 
474 aa  92.8  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.32 
 
 
474 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  32.18 
 
 
440 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
411 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.12 
 
 
472 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.15 
 
 
462 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.5 
 
 
471 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.67 
 
 
463 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  33.51 
 
 
560 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.64 
 
 
473 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
471 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 
470 aa  89.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 
453 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.78 
 
 
469 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  30 
 
 
499 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  26.15 
 
 
444 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.61 
 
 
467 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
469 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.48 
 
 
482 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  28.57 
 
 
468 aa  87.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
469 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 
461 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
469 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
469 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  24.88 
 
 
447 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  27.41 
 
 
469 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  32.22 
 
 
463 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  24.17 
 
 
437 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.06 
 
 
485 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
469 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.5 
 
 
887 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.77 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.77 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.77 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.77 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.77 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.77 
 
 
469 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.22 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.77 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  32.22 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  32.22 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1220  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.65 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.67 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  32.22 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.22 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  32.22 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.41 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 
472 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.41 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  30.23 
 
 
472 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 
462 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.77 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  29.51 
 
 
473 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.1 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 
473 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.67 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  30.11 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.82 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.18 
 
 
461 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.91 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  28.74 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.82 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  24.47 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.57 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  30.06 
 
 
468 aa  79.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.34 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.3 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>