More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1220 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1220  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.234885 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0491  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.14 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.680472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  29.49 
 
 		 395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  31.77 
 
 		 409 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  29.31 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  34.43 
 
 		 424 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  31.32 
 
 		 409 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 		 409 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.71 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.66 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  30.65 
 
 		 369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.35 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.55 
 
 		 362 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.43 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.14 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  27.18 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.23 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.23 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.23 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  29.89 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.8 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.26 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.26 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.26 
 
 		 362 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  27.42 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.53 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.75 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.41 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.39 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 		 422 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.84 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 		 401 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 410 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.54 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  38.15 
 
 		 454 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.15 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.21 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.12 
 
 		 351 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.4 
 
 		 359 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.78 
 
 		 379 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  34.98 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.44 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.8 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.1 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  25.38 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.18 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  34.1 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 428 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  37.91 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  36.36 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  33.52 
 
 		 413 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  37.66 
 
 		 413 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.68 
 
 		 367 aa  99  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0903  FAD linked oxidase domain protein  25.36 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0158726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  30.04 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  26.27 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.9 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.14 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.86 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  32.16 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.07 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  28.1 
 
 		 410 aa  96.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.14 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.88 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.61 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  25.43 
 
 		 377 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  35.68 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.89 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.49 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  26.03 
 
 		 444 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.62 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  26.6 
 
 		 452 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.67 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  27.08 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  41.79 
 
 		 461 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.06 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 		 464 aa  93.2  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.53 
 
 		 403 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.07 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.48 
 
 		 478 aa  92.4  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.39 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  25.89 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.35 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>