More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1718 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  100 
 
 		 425 aa  842    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  44.25 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.99 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  42.61 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  41.85 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  40.62 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  40.36 
 
 		 440 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  38.23 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  36.43 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  39.49 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  37.43 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.16 
 
 		 450 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.25 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  32 
 
 		 424 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.26 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  33.16 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  29.77 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  35.38 
 
 		 460 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  35.12 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  33.06 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.24 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  30.12 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  30.31 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.78 
 
 		 379 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  29.45 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  31.96 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.95 
 
 		 876 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  42.2 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.58 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.74 
 
 		 499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  27.03 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.35 
 
 		 887 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  32.23 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.75 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.83 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  27.34 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  31.84 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.86 
 
 		 362 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 		 474 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.89 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.61 
 
 		 890 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  31.02 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.56 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  27.4 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25.47 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.29 
 
 		 362 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.66 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.66 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.66 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.75 
 
 		 469 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.95 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  31.95 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.95 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.24 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.14 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  22.99 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  31.95 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.48 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.23 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.85 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  25.6 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.08 
 
 		 473 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.91 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.91 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.91 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  40.12 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.67 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.95 
 
 		 495 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.5 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  24.76 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  25.06 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  24.58 
 
 		 472 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.71 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  34.39 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.06 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  24.41 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>