More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5627 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  87.69 
 
 
472 aa  840    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
463 aa  951    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.21 
 
 
456 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  84.21 
 
 
456 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  80.78 
 
 
461 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  84.21 
 
 
456 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  63 
 
 
474 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  65.21 
 
 
453 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  62.74 
 
 
476 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  56.26 
 
 
481 aa  495  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 
468 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.68 
 
 
454 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  46.02 
 
 
452 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  44.27 
 
 
455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  43.05 
 
 
462 aa  335  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  39.61 
 
 
464 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  36.03 
 
 
452 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
440 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.27 
 
 
432 aa  275  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  34.73 
 
 
443 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  38.21 
 
 
457 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  38.21 
 
 
457 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  36.64 
 
 
433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.6 
 
 
444 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
442 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  36.98 
 
 
472 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.98 
 
 
433 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  34.62 
 
 
430 aa  247  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  35.91 
 
 
444 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  36.44 
 
 
436 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  36.95 
 
 
442 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  37.38 
 
 
432 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  36.54 
 
 
432 aa  233  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.16 
 
 
433 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
447 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 
433 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  35.41 
 
 
437 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  36.04 
 
 
432 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 
440 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  35.27 
 
 
436 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  33.26 
 
 
438 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
425 aa  199  7.999999999999999e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  34.52 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  36.43 
 
 
438 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  37.34 
 
 
438 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  29.87 
 
 
431 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.54 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.19 
 
 
431 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.61 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.11 
 
 
478 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.85 
 
 
481 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.92 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.12 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.12 
 
 
478 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.92 
 
 
478 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.23 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.39 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  30.48 
 
 
468 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  23.11 
 
 
478 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  29.41 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.96 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  23.86 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.06 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  22.41 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  33.87 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
460 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  33.78 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  23.81 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.83 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  33.59 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.41 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.73 
 
 
452 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.55 
 
 
482 aa  67  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.61 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  22.89 
 
 
428 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  23.16 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.48 
 
 
1027 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.6 
 
 
474 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
474 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.11 
 
 
461 aa  63.5  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  32.6 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
470 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  23.97 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.19 
 
 
481 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 
474 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.4 
 
 
409 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  23.75 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  30.46 
 
 
596 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  32.64 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  31.84 
 
 
473 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.78 
 
 
947 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 
500 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  30.17 
 
 
499 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 
487 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>