125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  974    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  62.95 
 
 
455 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.56 
 
 
456 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  60.52 
 
 
470 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  58.87 
 
 
481 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  56.44 
 
 
452 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  54.97 
 
 
460 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.78 
 
 
459 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.77 
 
 
460 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.07 
 
 
460 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  52.83 
 
 
481 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.53 
 
 
463 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.64 
 
 
463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  52.55 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.55 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.55 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  51.33 
 
 
466 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.82 
 
 
447 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  52.72 
 
 
493 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  49.32 
 
 
451 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  31.25 
 
 
497 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  28.19 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  30.33 
 
 
461 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.61 
 
 
463 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25 
 
 
483 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 
472 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  26.72 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.45 
 
 
453 aa  60.1  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  34.15 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  29.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 
456 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.15 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.08 
 
 
462 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  24.82 
 
 
456 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  24.82 
 
 
456 aa  57  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
474 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  31.71 
 
 
481 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.84 
 
 
761 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
460 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 
462 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.1 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
440 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.03 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 
468 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32.03 
 
 
461 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 
457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  31.5 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 
468 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  31.75 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.74 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.74 
 
 
478 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.41 
 
 
465 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  23.61 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  24.09 
 
 
443 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  32.84 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.35 
 
 
468 aa  48.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.25 
 
 
462 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.07 
 
 
478 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 
456 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.74 
 
 
478 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.74 
 
 
478 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  31.75 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.81 
 
 
471 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.63 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  28.32 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  28.7 
 
 
596 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  30.95 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  29.83 
 
 
462 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  29.92 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  29.6 
 
 
471 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.13 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  29.93 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  25.2 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  27.45 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.4 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 
466 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.36 
 
 
482 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.83 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  31.75 
 
 
495 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  27.97 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 
1012 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.07 
 
 
464 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
1020 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.92 
 
 
473 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.5 
 
 
453 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  32.5 
 
 
457 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>