83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1916 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1916  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  931    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0355003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0966  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.49 
 
 
460 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0207527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1076  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.71 
 
 
460 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0950999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1573  FAD linked oxidase domain protein  64.35 
 
 
455 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.54 
 
 
459 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.32 
 
 
459 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  61.32 
 
 
459 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  58.44 
 
 
460 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.04 
 
 
456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3340  FAD linked oxidase domain protein  57.3 
 
 
481 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.35 
 
 
463 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13751  hypothetical protein  58.68 
 
 
466 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.445765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4013  FAD linked oxidase domain protein  56.72 
 
 
481 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  57.37 
 
 
452 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.13 
 
 
463 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  57.83 
 
 
470 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3803  FAD linked oxidase domain protein  58.39 
 
 
493 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.935771  normal  0.2974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  57.78 
 
 
479 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.72 
 
 
447 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  43.78 
 
 
451 aa  349  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08967  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14300)  28.36 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.557658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  24.81 
 
 
578 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.78 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  30.46 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.03 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  24.02 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  36.3 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.15 
 
 
453 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.24 
 
 
483 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  31.65 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.62 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.11 
 
 
463 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 
443 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
476 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
462 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  31.54 
 
 
461 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.34 
 
 
520 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  28.64 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.48 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  23.35 
 
 
437 aa  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 
474 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
462 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  34.4 
 
 
473 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.2 
 
 
462 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  30.5 
 
 
520 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 
462 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
523 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  29.21 
 
 
437 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.74 
 
 
483 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  22.16 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  30 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.49 
 
 
493 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 
475 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  29.03 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 
440 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  28.05 
 
 
468 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.28 
 
 
474 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.64 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  29.3 
 
 
546 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  28.82 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.03 
 
 
448 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.95 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  30.83 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.95 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.77 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  28.12 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  28.78 
 
 
473 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  29.29 
 
 
521 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  30.83 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  29.17 
 
 
499 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.66 
 
 
462 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.61 
 
 
434 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 
465 aa  43.5  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.89 
 
 
447 aa  43.5  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.01 
 
 
456 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.37 
 
 
462 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 
462 aa  43.5  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>