More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4576 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.65 
 
 
520 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
523 aa  1056    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  91.59 
 
 
520 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  79.04 
 
 
517 aa  842    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.22 
 
 
516 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.49 
 
 
516 aa  777    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  45.27 
 
 
513 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 
510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.63 
 
 
465 aa  243  7e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.67 
 
 
467 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.99 
 
 
586 aa  218  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  32.52 
 
 
556 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 
470 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  35.09 
 
 
527 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  33.94 
 
 
525 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  33.94 
 
 
525 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  33.94 
 
 
525 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.99 
 
 
531 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.5 
 
 
521 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 
579 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  34.17 
 
 
527 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  31.24 
 
 
532 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.45 
 
 
529 aa  194  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.96 
 
 
451 aa  193  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.13 
 
 
563 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.1 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  34.69 
 
 
521 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.87 
 
 
484 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  44.18 
 
 
572 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 
518 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 
552 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.41 
 
 
550 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.26 
 
 
534 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.88 
 
 
524 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  31.6 
 
 
584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.98 
 
 
484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  29.98 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.75 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  29.98 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.98 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.75 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  32.97 
 
 
520 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  31.22 
 
 
456 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.35 
 
 
459 aa  170  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.12 
 
 
459 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 
564 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.48 
 
 
461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.53 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  28.37 
 
 
466 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 
565 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.63 
 
 
568 aa  160  8e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  31.94 
 
 
540 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
534 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  33.48 
 
 
545 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.92 
 
 
534 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  28.61 
 
 
534 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 
455 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  28.24 
 
 
459 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.23 
 
 
557 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  28.09 
 
 
502 aa  153  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.85 
 
 
459 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
572 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.45 
 
 
459 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.86 
 
 
470 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.7 
 
 
546 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.18 
 
 
470 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.18 
 
 
470 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.97 
 
 
470 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.97 
 
 
470 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.18 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.12 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.12 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  26.43 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.93 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  28.26 
 
 
538 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.22 
 
 
531 aa  147  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.76 
 
 
470 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.64 
 
 
470 aa  146  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 
466 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 
467 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
459 aa  144  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.92 
 
 
470 aa  143  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.35 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.38 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.17 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  26.06 
 
 
531 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  31.04 
 
 
532 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.88 
 
 
471 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  26.26 
 
 
531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.87 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  29.61 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 
473 aa  140  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  29.61 
 
 
469 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  29.61 
 
 
469 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  30.81 
 
 
527 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.38 
 
 
469 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>