More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1876 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
510 aa  1025    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.84 
 
 
516 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 
520 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  35.22 
 
 
517 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  37 
 
 
516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  36.13 
 
 
465 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 
523 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.1 
 
 
520 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.31 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  35.65 
 
 
513 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  38.07 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  34.51 
 
 
525 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  34.51 
 
 
525 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  34.51 
 
 
525 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.02 
 
 
527 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  32.99 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.18 
 
 
579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.29 
 
 
524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  33.82 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.39 
 
 
521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.77 
 
 
550 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.23 
 
 
586 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.97 
 
 
528 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 
518 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  33.26 
 
 
545 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  33.82 
 
 
532 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  31.25 
 
 
556 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  32.44 
 
 
521 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 
533 aa  203  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  30.35 
 
 
552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  30.25 
 
 
451 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  29.51 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.08 
 
 
563 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.5 
 
 
484 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.5 
 
 
484 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.29 
 
 
484 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.5 
 
 
484 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  29.5 
 
 
484 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  29.5 
 
 
484 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  29.5 
 
 
484 aa  194  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.29 
 
 
484 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.08 
 
 
557 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  31.21 
 
 
584 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.12 
 
 
568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.68 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.5 
 
 
534 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 
565 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  33.47 
 
 
520 aa  181  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
534 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  29.52 
 
 
559 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
531 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.3 
 
 
564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  31.67 
 
 
538 aa  174  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  27.2 
 
 
554 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.08 
 
 
540 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  41.06 
 
 
572 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  31.06 
 
 
531 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  31.06 
 
 
531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.86 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  29.38 
 
 
461 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.04 
 
 
459 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.82 
 
 
459 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  30.42 
 
 
479 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.66 
 
 
473 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  29.06 
 
 
466 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 
459 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  29.15 
 
 
495 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  29.84 
 
 
468 aa  151  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.52 
 
 
459 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.23 
 
 
459 aa  149  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.52 
 
 
469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  28.9 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
531 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.57 
 
 
546 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  28.09 
 
 
462 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.55 
 
 
462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  28.36 
 
 
583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.94 
 
 
469 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 
464 aa  147  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
469 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.81 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 
457 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.14 
 
 
471 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  29.75 
 
 
469 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.69 
 
 
470 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 
441 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  29.05 
 
 
532 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  30.14 
 
 
456 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.95 
 
 
457 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  29.54 
 
 
452 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 
469 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  29.66 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.11 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.54 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.33 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.69 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  26.13 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.91 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>