More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1372 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 
465 aa  933    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 
520 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.83 
 
 
516 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
451 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.89 
 
 
516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.95 
 
 
467 aa  280  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  35.79 
 
 
517 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.09 
 
 
520 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.13 
 
 
510 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 
523 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.59 
 
 
470 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  33.56 
 
 
513 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  32.71 
 
 
484 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  35.06 
 
 
521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.4 
 
 
528 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  32.98 
 
 
532 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  32.15 
 
 
484 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.94 
 
 
484 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  32.15 
 
 
484 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  31.94 
 
 
484 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  31.94 
 
 
484 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  31.73 
 
 
484 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  31.73 
 
 
484 aa  229  7e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  31.73 
 
 
484 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  33.95 
 
 
525 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  33.95 
 
 
525 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  33.95 
 
 
525 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  32.71 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.91 
 
 
521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  33.26 
 
 
527 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  35.19 
 
 
520 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  28.7 
 
 
563 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.75 
 
 
550 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.96 
 
 
540 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.72 
 
 
579 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  30.4 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  33.49 
 
 
527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.57 
 
 
586 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  29.53 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  31.36 
 
 
545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.13 
 
 
531 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
572 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.72 
 
 
534 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.41 
 
 
524 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.07 
 
 
568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  28.73 
 
 
584 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  29.35 
 
 
554 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.05 
 
 
557 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 
565 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  27.15 
 
 
559 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  27.27 
 
 
554 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.09 
 
 
533 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.4 
 
 
564 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
447 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  28.29 
 
 
538 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  28.21 
 
 
531 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 
531 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.42 
 
 
534 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.5 
 
 
456 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  29.31 
 
 
534 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  28.21 
 
 
531 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  29.59 
 
 
460 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 
534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.24 
 
 
546 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  28.79 
 
 
502 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.63 
 
 
476 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.24 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  40.68 
 
 
572 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  29.47 
 
 
472 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.51 
 
 
474 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 
487 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.54 
 
 
447 aa  151  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.99 
 
 
457 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.13 
 
 
452 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 
479 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  26.97 
 
 
474 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  30.43 
 
 
462 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
473 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  27.97 
 
 
461 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 
468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.71 
 
 
466 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  27.16 
 
 
532 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 
469 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  29.69 
 
 
461 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  29.98 
 
 
462 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.17 
 
 
462 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  26.23 
 
 
456 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  27.41 
 
 
499 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  26.87 
 
 
473 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  27.25 
 
 
495 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.57 
 
 
469 aa  144  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.14 
 
 
463 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  26 
 
 
583 aa  144  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  30.21 
 
 
462 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 
466 aa  143  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  27.41 
 
 
457 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>