More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  58.55 
 
 		 552 aa  661    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 557 aa  1138    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  60.04 
 
 		 584 aa  662    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  59.49 
 
 		 554 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.43 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  39.39 
 
 		 563 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  35.58 
 
 		 527 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.27 
 
 		 550 aa  350  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  35.58 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  35.58 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  35.58 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  35.04 
 
 		 527 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.04 
 
 		 556 aa  326  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.75 
 
 		 533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34 
 
 		 529 aa  317  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.96 
 
 		 528 aa  310  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.4 
 
 		 545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  34.06 
 
 		 532 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  32.38 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.9 
 
 		 521 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  31 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.25 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.31 
 
 		 524 aa  286  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 531 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.25 
 
 		 518 aa  286  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.93 
 
 		 534 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 		 534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  36.34 
 
 		 521 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  31.72 
 
 		 531 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 572 aa  273  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  31.54 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.3 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 		 565 aa  269  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  30.71 
 
 		 559 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  34.14 
 
 		 586 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.6 
 
 		 531 aa  256  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  34.12 
 
 		 520 aa  256  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  30.69 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 564 aa  239  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.54 
 
 		 546 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  30 
 
 		 534 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  31.7 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  31.08 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.25 
 
 		 467 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  30.56 
 
 		 502 aa  211  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.95 
 
 		 535 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.04 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  30.89 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  29.87 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.05 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.58 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  27.86 
 
 		 484 aa  157  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.67 
 
 		 484 aa  156  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  27.67 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  27.67 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 484 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.23 
 
 		 520 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  27.91 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  26.98 
 
 		 513 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.21 
 
 		 457 aa  123  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  33.83 
 
 		 572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.38 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.26 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  21.98 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  25.84 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.8 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  25.5 
 
 		 453 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.17 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.51 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.6 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  23.58 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  24.71 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.9 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  26.64 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.46 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  24.73 
 
 		 471 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.71 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.7 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.49 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.7 
 
 		 464 aa  100  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  23.71 
 
 		 472 aa  100  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  25.49 
 
 		 457 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  23.49 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.18 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  24.29 
 
 		 452 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 469 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  23.97 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>