More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2132 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.27 
 
 		 531 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.22 
 
 		 565 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1068    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  94.16 
 
 		 531 aa  1014    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.17 
 
 		 534 aa  704    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  56.34 
 
 		 559 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.69 
 
 		 533 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  54.89 
 
 		 538 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  53.18 
 
 		 583 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  36.66 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  40.26 
 
 		 532 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.66 
 
 		 531 aa  322  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.78 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  41.89 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  37.82 
 
 		 527 aa  316  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  37.96 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  37.96 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  37.96 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  36.4 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.48 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.67 
 
 		 521 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  39.03 
 
 		 545 aa  299  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  33.51 
 
 		 563 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  37.08 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.3 
 
 		 554 aa  293  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.52 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  34.91 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.4 
 
 		 568 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  37.31 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.06 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.72 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.63 
 
 		 524 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.42 
 
 		 564 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.84 
 
 		 586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.61 
 
 		 579 aa  236  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  30.69 
 
 		 534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.41 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.44 
 
 		 527 aa  200  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  32.25 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  32.44 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  33.06 
 
 		 532 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  30.77 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 535 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.82 
 
 		 554 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.76 
 
 		 536 aa  176  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  29.23 
 
 		 546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  28.19 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  27.98 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  27.76 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 516 aa  150  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.54 
 
 		 517 aa  150  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.99 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  27.15 
 
 		 520 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.65 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.36 
 
 		 484 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.36 
 
 		 484 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.36 
 
 		 484 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.58 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.36 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 		 572 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.1 
 
 		 499 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.65 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 		 451 aa  125  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.33 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  25.86 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.84 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  25.86 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.39 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 		 469 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.85 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  25.79 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  24.95 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 		 469 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.5 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  25.98 
 
 		 474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  23.95 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  24.17 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.98 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  25.11 
 
 		 474 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  24.73 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.97 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  25.97 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.97 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>