More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0015 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
583 aa  1201    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.46 
 
 
531 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  53 
 
 
531 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  53.18 
 
 
531 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.25 
 
 
534 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  46.14 
 
 
559 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.53 
 
 
565 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.94 
 
 
533 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  45.05 
 
 
538 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.98 
 
 
550 aa  336  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  36.56 
 
 
527 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.71 
 
 
545 aa  325  9e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.8 
 
 
528 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  34.48 
 
 
556 aa  320  5e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  36.7 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.3 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  35.78 
 
 
525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  35.78 
 
 
525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  35.78 
 
 
525 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  35.62 
 
 
532 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.62 
 
 
521 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34.74 
 
 
529 aa  299  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.19 
 
 
518 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  32.79 
 
 
552 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.26 
 
 
531 aa  296  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.28 
 
 
563 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.61 
 
 
524 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  36.1 
 
 
521 aa  290  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.72 
 
 
568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.18 
 
 
534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
554 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.11 
 
 
540 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.82 
 
 
557 aa  277  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  30.81 
 
 
584 aa  269  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  33.33 
 
 
520 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.15 
 
 
579 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  32.8 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  32.5 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  30.61 
 
 
586 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  32.11 
 
 
532 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 
536 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 
564 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 
546 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.29 
 
 
535 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  28.81 
 
 
527 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.25 
 
 
467 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  28.17 
 
 
534 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  27.4 
 
 
502 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  27.4 
 
 
534 aa  186  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27 
 
 
554 aa  160  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.22 
 
 
510 aa  153  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 
520 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  25.96 
 
 
465 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  26.62 
 
 
513 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.34 
 
 
516 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  26.94 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  25.52 
 
 
484 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.02 
 
 
516 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.9 
 
 
484 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  27.1 
 
 
484 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.9 
 
 
484 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.9 
 
 
484 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.69 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.69 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.69 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.69 
 
 
484 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  26.11 
 
 
517 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
572 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.17 
 
 
488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  24.4 
 
 
474 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.19 
 
 
473 aa  114  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.61 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  24.13 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  24.11 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.25 
 
 
467 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  23.22 
 
 
474 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  23.58 
 
 
474 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  25.79 
 
 
478 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  23.3 
 
 
469 aa  107  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.29 
 
 
464 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.33 
 
 
473 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.31 
 
 
457 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.31 
 
 
457 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  22.08 
 
 
470 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.68 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  22.7 
 
 
457 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.73 
 
 
475 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.11 
 
 
471 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.74 
 
 
470 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 
469 aa  100  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 
466 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.69 
 
 
457 aa  98.6  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>