More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44190 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  100 
 
 
554 aa  1140    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.34 
 
 
563 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 
552 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.89 
 
 
568 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  30.56 
 
 
584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.69 
 
 
557 aa  232  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  29.29 
 
 
554 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  31.47 
 
 
532 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 
533 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  27.39 
 
 
538 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  28.46 
 
 
525 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  28.46 
 
 
525 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  28.46 
 
 
525 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  29.63 
 
 
529 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.47 
 
 
565 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  27.93 
 
 
559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  28.25 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.23 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 
531 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  28.18 
 
 
531 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  27.82 
 
 
531 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 
534 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.35 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  27.66 
 
 
556 aa  174  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  26.28 
 
 
586 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.54 
 
 
524 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  26.2 
 
 
527 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  28.03 
 
 
528 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.4 
 
 
521 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  27.49 
 
 
540 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 
572 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  26.54 
 
 
527 aa  160  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  25.67 
 
 
534 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.29 
 
 
534 aa  158  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.49 
 
 
564 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  27 
 
 
583 aa  157  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  28.07 
 
 
546 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  27.61 
 
 
521 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  25.26 
 
 
502 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  28.48 
 
 
532 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  27.11 
 
 
534 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  25.96 
 
 
527 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.35 
 
 
518 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  26.98 
 
 
531 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 
536 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.53 
 
 
535 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.44 
 
 
516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.55 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  26.37 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  28.02 
 
 
532 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  25.61 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  27.38 
 
 
531 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.51 
 
 
520 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.29 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  24.82 
 
 
572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  27.19 
 
 
520 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.38 
 
 
510 aa  127  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.37 
 
 
523 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.05 
 
 
451 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.8 
 
 
516 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.71 
 
 
520 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  32.84 
 
 
499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.3 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.3 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.71 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  26.3 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.3 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  26.3 
 
 
470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.35 
 
 
470 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.87 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.49 
 
 
470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.65 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
460 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.65 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 
452 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  25.87 
 
 
473 aa  107  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.38 
 
 
473 aa  107  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.95 
 
 
457 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  27.11 
 
 
479 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 
466 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
474 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.32 
 
 
459 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  24.35 
 
 
474 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.36 
 
 
457 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  25.38 
 
 
453 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 
461 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
462 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.56 
 
 
469 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.17 
 
 
459 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  31.17 
 
 
474 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.2 
 
 
459 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.84 
 
 
470 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 
478 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
474 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.32 
 
 
467 aa  100  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.09 
 
 
492 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  30.95 
 
 
456 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.47 
 
 
459 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 
469 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>