More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1270 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  89.98 
 
 		 531 aa  948    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 532 aa  1084    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  92.86 
 
 		 532 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  50.19 
 
 		 534 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  50.56 
 
 		 534 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  54.32 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  51.3 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.11 
 
 		 536 aa  525  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  53.51 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.92 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  37.24 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  38.81 
 
 		 525 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  38.81 
 
 		 525 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  38.81 
 
 		 525 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  36.55 
 
 		 556 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.02 
 
 		 550 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  35.85 
 
 		 527 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.89 
 
 		 518 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  38.72 
 
 		 532 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  32.98 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.79 
 
 		 563 aa  263  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.4 
 
 		 521 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.56 
 
 		 524 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.01 
 
 		 528 aa  256  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  36.85 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.33 
 
 		 531 aa  250  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  37.74 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  36.65 
 
 		 545 aa  248  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  32.69 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 		 572 aa  242  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  31.96 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.5 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.6 
 
 		 568 aa  233  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  33.06 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  32.65 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.98 
 
 		 557 aa  226  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  37.74 
 
 		 520 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 531 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.14 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  28.87 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  29.24 
 
 		 538 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  27.4 
 
 		 586 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.77 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 579 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  29.57 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.46 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 510 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  28.43 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.18 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.7 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.51 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  29.14 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  27.04 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.48 
 
 		 451 aa  127  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  26.21 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.28 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.28 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.23 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.68 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.06 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.06 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.06 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.06 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.93 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.06 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.28 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  27.62 
 
 		 461 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.27 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.62 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.21 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.44 
 
 		 475 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.28 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.91 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.33 
 
 		 461 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.21 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.84 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  25.99 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.61 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  23.41 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.78 
 
 		 459 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.4 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  24.06 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.32 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  28.7 
 
 		 455 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  25.38 
 
 		 462 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  28.95 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.06 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.11 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  25.43 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.08 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.2 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  25.26 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>