More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2238 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 		 532 aa  1048    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  67.3 
 
 		 528 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  75.43 
 
 		 521 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.04 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  58.49 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  54.44 
 
 		 529 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  55.51 
 
 		 527 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  57.9 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  56.08 
 
 		 525 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.26 
 
 		 572 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  54.37 
 
 		 527 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  55.09 
 
 		 521 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.89 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  54.98 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.69 
 
 		 531 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.57 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  48.7 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  41.24 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.85 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  40.26 
 
 		 531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  40.26 
 
 		 531 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.15 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  36.41 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.58 
 
 		 563 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 		 534 aa  322  9.000000000000001e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.05 
 
 		 584 aa  320  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  35.62 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  34.5 
 
 		 559 aa  309  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.41 
 
 		 565 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 		 568 aa  301  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.06 
 
 		 557 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.65 
 
 		 546 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  35.41 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 		 536 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.77 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.28 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.94 
 
 		 534 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  37.88 
 
 		 532 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.11 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.62 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  34.07 
 
 		 527 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  36.06 
 
 		 531 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  38.38 
 
 		 532 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.88 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.48 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.35 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.54 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  33.96 
 
 		 470 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 		 516 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  33.18 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  31.47 
 
 		 554 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.66 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  32.6 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  30.14 
 
 		 484 aa  187  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.14 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.14 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  30.26 
 
 		 484 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.14 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.22 
 
 		 451 aa  180  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  39.85 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.27 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  32.18 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  32.57 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  32.57 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  32.57 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.02 
 
 		 459 aa  148  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  32.34 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.34 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.34 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.34 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.36 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.28 
 
 		 476 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  28.27 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.82 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.61 
 
 		 472 aa  143  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  30.42 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.74 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.36 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.02 
 
 		 462 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.02 
 
 		 469 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  29.1 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  31.88 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>