More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1558 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  76.27 
 
 		 531 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1077    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  76.46 
 
 		 531 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.17 
 
 		 534 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.52 
 
 		 565 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  56.9 
 
 		 559 aa  621  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.82 
 
 		 533 aa  615  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  53.46 
 
 		 583 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  56.1 
 
 		 538 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  38.34 
 
 		 556 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  40.15 
 
 		 532 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.96 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  42.1 
 
 		 550 aa  326  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  36.81 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.67 
 
 		 521 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.92 
 
 		 572 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  38.18 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  38.18 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  38.18 
 
 		 525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.41 
 
 		 531 aa  303  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.77 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  37.59 
 
 		 545 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.65 
 
 		 534 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  36.26 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  32.21 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  38.76 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  34.22 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.34 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.92 
 
 		 568 aa  277  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.13 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.12 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.82 
 
 		 540 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  36.38 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.25 
 
 		 586 aa  229  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 564 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.59 
 
 		 527 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.35 
 
 		 467 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  29.95 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  30.68 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.71 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  31.97 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  31.14 
 
 		 532 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  28.14 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  30.41 
 
 		 532 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  29.36 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  28.83 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.51 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.64 
 
 		 517 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.51 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  28.96 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.22 
 
 		 523 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  26.82 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 484 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 		 484 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.82 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.82 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.82 
 
 		 484 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.18 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  25.82 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.31 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.48 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.71 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.6 
 
 		 473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.01 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  26.25 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  32.73 
 
 		 572 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.34 
 
 		 469 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  24.43 
 
 		 469 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  24.95 
 
 		 471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  25.68 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  26.93 
 
 		 473 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.43 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  24.37 
 
 		 472 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  26.67 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.67 
 
 		 469 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.67 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.67 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.67 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.19 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  24.95 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.02 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  25.42 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.81 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 		 447 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  24.54 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  26.23 
 
 		 499 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>